TmRNA

тмРНК (tmRNA, 10S RNA)  — «транспортно-матричная» РНК. Часть тмРНК по структуре аналогична транспортной РНК, и после аминоацилирования несёт остаток аланина, другая же кодирует короткий пептид. Ген этой РНК, SsrA, обнаружен во всех отсеквенированных бактериальных геномах и играет важную роль в регуляции трансляции.

Функции тмРНК

Трансляция неполных, не содержащих стоп-кодонов мРНК приводит к тому, что рибосома задерживается на таких РНК, так как невозможна нормальная терминация трансляции и освобождение рибосомных субчастиц. Также задержка рибосомы происходит на участках РНК, содержащих несколько идущих подряд «редких» кодонов. Не до конца транслированный фрагмент мРНК при этом расщепляется нуклеазами.

тмРНК, в комплексе с белком SmpB, участвует в терминации трансляции по следующему механизму:

1. тРНК-подобная часть тмРНК попадает в А-сайт рибосомы;
2. происходит транспептидация, перенос недосинтезированного пептида на аланин в составе тмРНК;
3. далее на матрице тмРНК синтезируется метка
4. на стоп-кодоне тмРНК происходит терминация трансляции, а помеченный белок подвергается протеолизу.

Литература

• Roche, ED; Sauer RT (1999). "SsrA-mediated peptide tagging caused by rare codons and tRNA scarcity.". EMBO J. 18(16): 4579-89. PMID 10449423.

Cсылки

• tmRDB: A database of tmRNA sequences
• The tmRNA website
• Rfam entry for tmRNA