Малые ядрышковые РНК

Малые ядрышковые РНК

Малые ядрышковые РНК (мякРНК, англ. snoRNA) — класс малых РНК, участвующих в химических модификациях (метилировании и псевдоуридилировании) рибосомных РНК, а также тРНК и малых ядерных РНК. По классификации MeSH малые ядрышковые РНК считаются подгруппой малых ядерных РНК. мякРНК обычно относят к «гидовым» РНК, однако их нельзя путать с гидовыми РНК, направляющими редактирование РНК у трипаносом.

Содержание

Модификации, направляемые мякРНК

После транскрипции генов рРНК образующиеся молекулы (называемые пре-рРНК), для того, чтобы превратиться в зрелые рРНК, должны быть подвергнуты серии шагов процессирования. Процессирование включает метилирование и псевдоуридилирование, направляемые мякРНК.

  • Метилирование — присоединение метильных групп к различным субстратам. рРНК человека содержат приблизительно 115 модификаций, являющихся метилированием. Большая часть таких модификаций — метилирование по 2’O атому рибозы.[1]
  • Псевдоуридилирование — изомеризация уридина в псевдоуридин(Ψ). Зрелые рРНК человека содержат около 95 остатков псевдоуридина[1]. Каждая молекула мякРНК действует в качестве «направляющей» только для одной-двух модификаций целевой РНК. При этом каждая молекула мякРНК связана по меньшей мере с четырьмя молекулами белка, образуя РНК-белковый комплексы, называемые малыми ядрышковыми рибонуклопротеидами (англ. snoRNP). То, какие белки входят в состав комплекса, зависит от типа мякРНК(см. ниже). Молекула мякРНК содержит последовательность из 10-20 нуклеотидов, комплементарную последовательности, в состав которой входит модифицируемый нуклеотид, что позволяет мякРНК специфично связываться с необходимым участком процессируемой рРНК. После связывания мякРНК с процессируемым сайтом белки, входящие в состав комплекса, осуществляют катализ химической модификации основания.
Пример вторичной структуры мякРНК SNORD73(RF00071), относящейся к классу C/D box, взятый из базы данных Rfam

Значение модификаций рРНК

Влияние метилирования и псевдоуридилирования на функции зрелой рРНК изучено недостаточно. Вероятно, модификации не являются необходимыми, но известно, что они несколько улучшают укладку РНК и взаимодействие с рибосомными белками. При этом, модификации расположены исключительно в консервативных и функционально важных доменах рРНК и схожи у эволюционно удалённых групп эукариот.[2].

  1. 2'-O-метилирование рибозы стабилизирует 3'-эндо конформацию.
  2. Псевдоуридин (Ψ), по сравнению с уридином имеет дополнительную возможность для образования водородных связей.
  3. Сильно метилированная РНК защищена от гидролиза. rRNA acts as a ribozyme by catalyzing its own hydrolysis and splicing.

Организация в составе генома

Большая часть генов мякРНК позвоночных расположены в интронах генов, кодирующих белки, вовлечённые в сборку рибосом или трансляцию. Гены мякРНК транскрибируются РНК-полимеразой II типа, но могут и транскрибироваться с собственных промоторов, РНК-полимеразой II или III типа.

Другие функции

Недавно было обнаружено, что мякРНК имеют функции, не связанные с рРНК. Одна из таких функций состоит в регуляции альтернативного сплайсинга транс-транскриптов, осуществляемой мякРНК под названием HBII-52 (SNORD115).[3]

Примечания

  1. 1 2 Maden BE, Hughes JM (1997). «Eukaryotic ribosomal RNA: the recent excitement in the nucleotide modification problem». Chromosoma 105 (7-8): 391–400. PMID 9211966.
  2. Bachellerie, JP; Cavaille J, Huttenhofer A (2002). «The expanding snoRNA world». Biochimie 84: 775–790. DOI:10.1016/S0300-9084(02)01402-5. PMID 12457565.
  3. Kishore S, Stamm S (2006). «The snoRNA HBII-52 regulates alternative splicing of the serotonin receptor 2C». Science 311 (5758): 230–231. DOI:10.1126/science.1118265. PMID 16357227.




Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "Малые ядрышковые РНК" в других словарях:

  • Малые ядерные РНК — (мяРНК, snRNA)  класс РНК, которые встречаются в ядре эукариотических клеток. Они транскрибируются РНК полимеразой II или РНК полимеразой III и участвуют в важных процессах, таких как сплайсинг (удаление интронов из незрелой мРНК), регуляции …   Википедия

  • Малые интерферирующие РНК — или короткие интерферирующие РНК (англ. siRNA, small interfering RNA)  это класс двухцепочечных РНК, длиной 20 25 нуклеотидов. Малые интерферирующие РНК принимают участие в процессах РНК интерференции (англ. RNAi), понижая… …   Википедия

  • Малые РНК, образующие шпильки — Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA  short hairpin RNA, small hairpin RNA)  молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии… …   Википедия

  • РНК — Пре мРНК со стеблем петлёй. Атомы азота в основаниях выделены голубым, кислорода в фосфатном остове молекулы  красным Рибонуклеиновые кислоты (РНК)  нуклеиновые кислоты, полимеры нуклеотидов, в состав которых входят остаток ортофосфорной кислоты …   Википедия

  • РНК (биология) — Пре мРНК со стеблем петлёй. Атомы азота в основаниях выделены голубым, кислорода в фосфатном остове молекулы  красным Рибонуклеиновые кислоты (РНК)  нуклеиновые кислоты, полимеры нуклеотидов, в состав которых входят остаток ортофосфорной кислоты …   Википедия

  • Малые РНК — Некодирующие РНК (non coding RNA, ncRNA) это молекулы РНК, которые не транслируются в белки. Ранее использовавшийся синоним, малые РНК (smRNA, small RNA), в настоящее время не используется, так как некоторые некодирующие РНК могут быть очень… …   Википедия

  • РНК-ген — Некодирующие РНК (non coding RNA, ncRNA) это молекулы РНК, которые не транслируются в белки. Ранее использовавшийся синоним, малые РНК (smRNA, small RNA), в настоящее время не используется, так как некоторые некодирующие РНК могут быть очень… …   Википедия

  • Некодирующие РНК — Рибозим лигазы Некодирующие РНК (non coding RNA, ncRNA) это молекулы РНК, которые не транслируются …   Википедия

  • Некодирующая РНК — Некодирующие РНК (non coding RNA, ncRNA) это молекулы РНК, которые не транслируются в белки. Ранее использовавшийся синоним, малые РНК (smRNA, small RNA), в настоящее время не используется, так как некоторые некодирующие РНК могут быть очень… …   Википедия

  • Информационная РНК — Основные этапы жизненного цикла мРНК эукариот Матричная рибонуклеиновая кислота (мРНК, синоним информационная РНК, иРНК) РНК, отвечающая за перенос информации о первичной структуре белков от ДНК к местам синтеза белков. мРНК синтезируется на… …   Википедия


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»