Малые РНК, образующие шпильки

Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA — short hairpin RNA, small hairpin RNA) — молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии генов путем РНК-интерференции. Короткие РНК, образующие шпильки, вводят в клетки при помощи вектора, использующего промотор U6, для обеспечения конститутивной экспрессии. Такой вектор, как правило, передается дочерним клеткам и обеспечивает наследуемое выключения гена.

Структура малых РНК, образующих шпильки, разрезается клеточными ферментами в малые интерферирующие РНК (siRNA), которые далее переходят в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RISC). Этот комплекс связывается и разрезает мРНК, участки которых комплементарны siRNA.

Малые РНК, образующие шпильки, транскрибируются РНК полимеразой III. Образование shRNA в клетках млекопитающих иногда вызывает интерфероновый ответ, для защиты клетки, как в случае вирусной атаки. Такие процессы не наблюдаются в случае miRNA (микроРНК), которые транскрибируются РНК полимеразой II.

Малые РНК, образующие шпильки, также используются и у растений. но в таком случае, не используют промотор U6. В растениях обычно используют традиционный промотор, обеспечивающий конститутивную экспрессию, — CaMV35S из вируса мозаики цветной капусты (cauliflower mosaic virus 35S promoter).