Small hairpin RNA

Small hairpin RNA

Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA — short hairpin RNA, small hairpin RNA) — молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии генов путем РНК-интерференции. Короткие РНК, образующие шпильки, вводят в клетки при помощи вектора, использующего промотор U6, для обеспечения конститутивной экспрессии. Такой вектор, как правило, передается дочерним клеткам и обеспечивает наследуемое выключения гена.

Структура малых РНК, образующих шпильки, разрезается клеточными ферментами в малые интерферирующие РНК (siRNA), которые далее переходят в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RISC). Этот комплекс связывается и разрезает мРНК, участки которых комплементарны siRNA.

Малые РНК, образующие шпильки, транскрибируются РНК полимеразой III. Образование shRNA в клетках млекопитающих иногда вызывает интерфероновый ответ, для защиты клетки, как в случае вирусной атаки. Такие процессы не наблюдаются в случае miRNA (микроРНК), которые транскрибируются РНК полимеразой II.

Малые РНК, образующие шпильки, также используются и у растений. но в таком случае, не используют промотор U6. В растениях обычно используют традиционный промотор, обеспечивающий конститутивную экспрессию, — CaMV35S из вируса мозаики цветной капусты (cauliflower mosaic virus 35S promoter).

Типы нуклеиновых кислот
Азотистые основания Пурины (Аденин, Гуанин) | Пиримидины (Урацил, Тимин, Цитозин)
Нуклеозиды Аденозин | Гуанозин | Уридин | Тимидин | Цитидин
Нуклеотиды монофосфаты (АМФ, ГМФ, UMP, ЦМФ) | дифосфаты (АДФ, ГДФ, УДФ, ЦДФ) | трифосфаты (АТФ, ГТФ, УТФ, ЦТФ) | циклические (цАМФ, цГМФ, cADPR)
Рибонуклеиновые кислоты РНК | мРНК | тРНК | рРНК | антисмысловые РНК | микроРНК | некодирующие РНК | piwi-interacting RNA | shRNA | малые интерферирующие РНК | малые ядерные РНК | малые ядрышковые РНК | тмРНК
Дезоксирибонуклеиновые кислоты ДНК | кДНК | Геном | msDNA | Митохондриальная ДНК
Аналоги нуклеиновых кислот GNA | LNA | ПНК | TNA | Морфолино
Типы векторов en:phagemid | Плазмиды | Фаг лямбда | en:cosmid | en:P1 phage | en:fosmid | BAC | YAC | HAC
Основные группы биохимических молекул

Аминокислоты · Пептиды · Белки · Углеводы · Нуклеотиды · Нуклеиновые кислоты · Липиды · Терпены · Каротиноиды · Стероиды · Флавоноиды · Алкалоиды · Гликозиды

 



Wikimedia Foundation. 2010.

Игры ⚽ Нужно сделать НИР?

Полезное


Смотреть что такое "Small hairpin RNA" в других словарях:

  • Small hairpin RNA — A small hairpin RNA or short hairpin RNA (shRNA) is a sequence of RNA that makes a tight hairpin turn that can be used to silence gene expression via RNA interference. shRNA uses a vector introduced into cells and utilizes the U6 promoter to… …   Wikipedia

  • Small interfering RNA — (siRNA), sometimes known as short interfering RNA or silencing RNA, is a class of 20 25 nucleotide long double stranded RNA molecules that play a variety of roles in biology. Most notably, siRNA is involved in the RNA interference (RNAi) pathway …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA SNORA44 — (also known as ACA44) is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifiying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA SNORA58 — (also known as ACA58) is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifiying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA SNORA68 — (also known as U68) is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifiying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site… …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA SNORA69 — (also known as U69) is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site of …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA SNORA72 — (also known as U72) is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifiying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site… …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA SNORA70 — (also known as U70) is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifiying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site… …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA MBI-161 — is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifiying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site of snRNA biogenesis.… …   Wikipedia

  • Small nucleolar RNA MBI-28 — is a non coding RNA (ncRNA) molecule which functions in the biogenesis (modification) of other small nuclear RNAs (snRNAs). This type of modifiying RNA is located in the nucleolus of the eukaryotic cell which is a major site of snRNA biogenesis.… …   Wikipedia


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
… Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»