Последовательность Шайна


Последовательность Шайна

Последовательность Шайна — Дальгарно (англ. Shine-Dalgarno sequence, Shine-Dalgarno box) — сайт связывания рибосом на молекуле мРНК прокариот, обычно на расстоянии около 10 нуклеотидов до стартового кодона AUG.[1] Описана австралийскими учёными Джоном Шайном и Линн Дальгарно.[2]

Консенсусом является последовательность из шести нуклеотидов AGGAGG; в случае E. coli последовательность Шайна — Дальгарно — AGGAGGU. Комплементарная последовательность CCUCCU, называемая последовательностью анти-Шайна — Дальгарно, располагается на 3'-конце молекулы 16S рибосомной РНК. Кoмплементарное взаимодействие между последовательностями Шайна — Дальгарно и анти-Шайна — Дальгарно служит для помещения старт-кодона мРНК в P-сайт рибосомы для начала биосинтеза белка.[3]

Мутации в последовательности Шайна — Дальгарно снижают эффективность трансляции. Это обусловлено снижением эффективности образования комплекса мРНК-30S рибосомная субъединица.[уточнить] Показано, что комплементарные мутации в последовательности анти-Шайна — Дальгарно обеспечивают восстановление эффективности трансляции.

В момент образования комплекса последовательности Шайна — Дальгарно и анти-Шайна — Дальгарно, с 30S-рибосомной субъединицей связываются и факторы инициации трансляции IF2-GTP, IF1, IF3, а также инициаторная формилметионил-тРНК (fMet-tRNA). К образовавшемуся преинициаторному комплексу затем присоединяется 50S-рибосомная субъединица.[4]

Содержание

Белок S1 рибосом грамотрицательных бактерий

У грамотрицательных бактерий наличие последовательности Шайна — Дальгарно не является обязательным для распознавания старт-кодона. Например, показано, что делеция последовательности Шайна — Дальгарно из 16S рРНК не приводит к инициации трансляции по неправильным сайтам. Более того, некоторые мРНК прокариот вообще не содержат последовательности Шайна — Дальгарно. По-видимому, рибосомный белок S1 связывается с AU-богатыми последовательностями, которые находятся на расстоянии 15-30 нуклеотидов до стартового кодона.

См. также

Примечания

  1. Kapp L. D., Lorsch J. R. The molecular mechanics of eukaryotic translation // Annual Review of Biochemistry 73/2004, 657—704
  2. Shine J., Dalgarno L. Determinant of cistron specificity in bacterial ribosomes // Nature. — 1975. — Vol. 254. — № 5495. — P. 34–8. — DOI:10.1038/254034a0 — PMID 803646.
  3. Noller H. F. Structure of the bacterial ribosome and some implications for translational regulation // Translational Control in Biology and Medicine / Edited by N. Sonenberg, J. W. B. Hershey and M. B. Mathews. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Press, 2007. P. 41-58
  4. Benelli D., Londei P. Begin at the beginning: evolution of translational initiation // Research in Microbiology 160, 2009, 493—501

Литература

  • Voet D., Voet J. Biochemistry. — 3rd ed. — John Wiley and Sons, 2004. — P. 1321—1322, 1342—1343.

Ссылки



Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "Последовательность Шайна" в других словарях:

  • Последовательность Шайна-Дальгарно — (англ. Shine Dalgarno sequence, Shine Dalgarno box) была описана австралийскими учеными Джоном Шайном и Линн Дальгарно[1] и является сайтом связывания рибосом на молекуле мРНК прокариот, обычно на расстоянии около 10 нуклеотидов до… …   Википедия

  • Последовательность Шайна-Далгарно сайт связывания рибосом — Последовательность Шайна Далгарно, сайт связывания рибосом * паслядоўнасць Шайна Далгарна, сайт звязвання рыбасом * Shain Dalgarno sequence or SD s. or ribosome binding site …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • последовательность Шайна-Дальгарно — сайт связывания рибосом 5' концевая последовательность нуклеотидов в составе мРНК (каноническая форма АГГАГГ), предваряющая инициирующий кодон АУГ; П.Ш. Д. комплементарна 3' концу 16S рРНК и обеспечивает присоединение мРНК к рибосоме;… …   Справочник технического переводчика

  • последовательность Шайна-Дальгарно — Shine Dalgarno sequence, SD sequence, ribosome binding site последовательность Шайна Дальгарно, сайт связывания рибосом. 5’ концевая последовательность нуклеотидов в составе мРНК (каноническая форма АГГАГГ), предваряющая инициирующий кодон АУГ; П …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • Шайна-Далгарно последовательность сайт связывания рибосом — Шайна Далгарно последовательность, сайт связывания рибосом * ШайнаДалгарно паслядоўнасць, сайт звязвання рыбасом * Shine Dalgarno sequence or SD s. or ribosome recognition s. or r. bind (по Kahl, 1995) ing site сайт, связывающий рибосому (см.) на …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • Консенсусная последовательность Козак — (последовательность Козак, англ. Kozak consensus sequence) последовательность нуклеотидов в составе молекулы мРНК эукариот, окружающая старт кодон и важная для инициации трансляции. Консенсусная последовательность была впервые описана… …   Википедия

  • лидерная последовательность — leader sequence лидерная последовательность. Нетранслируемая последовательность мРНК, расположенная между ее 5’ концом и инициаторным кодоном АУГ; Л.п. может включать ряд регуляторных элементов например, аттенюатор <attenuator> (как в… …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • Лидерная последовательность лидер — Лидерная последовательность, лидер * лідарная паслядоўнасць, лідар * leader sequence or leader 1. Транскрибируемая часть эукариотического гена, следующая за кэп сайтом () и предшествующая стартовому кодону () с консенсусной последовательностью 3… …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • Трансляция (биология) — У этого термина существуют и другие значения, см. Трансляция. Трансляция (от лат. translatio  перевод)  процесс синтеза белка из аминокислот на матрице информационной (матричной) РНК (иРНК, мРНК), осуществляемый рибосомой.… …   Википедия

  • SD sequence — SD sequence. См. последовательность Шайна Дальгарно. (Источник: «Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В.А., Лисовенко Л.А., Москва: Изд во ВНИРО, 1995 г.) …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.