Thaumarchaeota

Thaumarchaeota
Научная классификация
Домен:  Археи Тип:  Thaumarchaeota
Международное научное название
Thaumarchaeota Brochier-Armanet et al., 2008
Классификация
См. текст
Систематика на Викивидах Поиск изображений на Викискладе

Thaumarchaeota (от греч. thaumas — «чудо») — новый выделенный тип архей, пока содержащий 4 вида: Nitrosopumilus maritimus, Cenarchaeum symbiosum, Nitrososphaera viennensis,^[1] и Nitrososphaera gargensis^[2]. Все открытые на данный момент особи являются хемолитотрофами и окисляют аммиак. Они могут играть важную роль в биохимическом круговороте веществ, а также круговоротах углерода и азота.

История

Тип был выделен в 2008 году на основании филогенетических данных, таких как последовательности генов рРНК этих организмов, а также образование ими топоизомеразы I типа, который раньше считался уникальным для эукариот^[2][3]. Эти положения были подтверждены дополнительными анализами, результаты которых были опубликованы в 2010 году. В них проверялись геномы окисляющих аммиак архей Nitrosopumilus maritimus и Nitrososphaera gargensis. По результатам этих исследований было установлено, что эти два вида имеют отдельное происхождение вместе с другим видом, Cenarchaeum symbiosum, который был первым описанным видом Thaumarchaeota^[4].

Классификация

• "Candidatus Caldiarchaeum" Nunoura et al. 2011
  • "Candidatus Caldiarchaeum subterraneum" Nunoura et al. 2011
• "Candidatus Giganthauma" Muller et al. 2010
  • "Candidatus Giganthauma insulaporcus" Muller et al. 2010
  • "Candidatus Giganthauma karukerense" Muller et al. 2010
• "Candidatus Nitrosotalea" Lehtovirta 2011
  • "Candidatus Nitrosotalea devanaterra" Lehtovirta 2011
• Cenarchaeales Cavalier-Smith 2002
  • "Cenarchaeaceae" DeLong and Preston 1996
    • Cenarchaeum ♠ DeLong and Preston 1996
      • Cenarchaeum symbiosum ♠ DeLong and Preston 1996
• "Nitrososphaerales" Tourna et al. 2011
  • "Nitrososphaeraceae" Tourna et al. 2011
    • Nitrososphaera ♠ Tourna et al. 2011
      • "Candidatus Nitrososphaera gargensis" Tourna et al. 2011
      • Nitrososphaera viennensis ♠ Tourna et al. 2011
• "Candidatus Nitrosopumilales" Konneke et al. 2005
  • "Candidatus Nitrosopumilaceae" Konneke et al. 2005
    • "Candidatus Nitrosoarchaeum" Blainey et al. 2011
      • "Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis" Kim et al. 2011
      • "Candidatus Nitrosoarchaeum limnia" Blainey et al. 2011
    • "Candidatus Nitrosopumilus" Konneke et al. 2005
      • "Candidatus Nitrosopumilus salaria" Mosier et al. 2012
      • "Candidatus Nitrosopumilus maritimus" Konneke et al. 2005

Candidatus — возможно, таксон занимает данное положение

Примечания

1. ↑ (2011) «Nitrososphaera viennensis, an ammonia oxidizing archaeon from soil». Proceedings of the National Academy of Sciences 108 (20): 8420–5. DOI:10.1073/pnas.1013488108. PMID 21525411.
2. ↑ ^{1 2} (2008) «Mesophilic crenarchaeota: Proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota». Nature Reviews Microbiology 6 (3): 245–52. DOI:10.1038/nrmicro1852. PMID 18274537.
3. ↑ (2008) «A DNA topoisomerase IB in Thaumarchaeota testifies for the presence of this enzyme in the last common ancestor of Archaea and Eucarya». Biology Direct 3: 54. DOI:10.1186/1745-6150-3-54. PMID 19105819.
4. ↑ (2010) «Distinct gene set in two different lineages of ammonia-oxidizing archaea supports the phylum Thaumarchaeota». Trends in Microbiology 18 (8): 331–40. DOI:10.1016/j.tim.2010.06.003. PMID 20598889.