- тмРНК
-
тмРНК (tmRNA, 10S RNA) — «транспортно-матричная» рибонуклеиновая кислота. Часть тмРНК по структуре аналогична транспортной РНК, и после аминоацилирования несёт остаток аланина, другая же кодирует короткий пептид (маркер протеолиза). тмРНК кодируется геном ssrA, который в большинстве случаев кодирует тмРНК, состоящую из одной цепи нуклеотидов; у некоторых альфа- и бета-протеобактерий, цианобактерий и в примитивных митохондриях протист семейства Jakobidae измененный ген ssrA кодирует тмРНК, состоящую из двух отдельных РНК, которые соединены комплементарным спариванием оснований. В цитоплазме тмРНК образует рибонуклеопротеидный комплекс (tmRNP) с маленьким белком В (Small Protein B, SmpB), фактором элонгации Tu (EF-Tu) и рибосомным белком S1.
Функции тмРНК
Трансляция неполных, не содержащих стоп-кодонов мРНК приводит к тому, что рибосома задерживается на таких РНК, так как невозможна нормальная терминация трансляции и диссоциация рибосомных субъединиц. Также задержка рибосомы происходит на участках РНК, содержащих несколько идущих подряд «редких» кодонов.
В таких случаях тмРНК участвует в терминации трансляции по механизму, называемому транс-трансляцией:
- тРНК-подобная часть тмРНК попадает в А-сайт рибосомы;
- происходит транспептидация, перенос недосинтезированного пептида на аланин в составе тмРНК;
- далее на матрице тмРНК синтезируется метка из 11 аминокислот - (A)ANDENYALAA (включая уже присоединенный аланин); считывание кодонов при этом происходит с MLR-региона (messenger RNA-like region) тмРНК;
- на стоп-кодоне тмРНК происходит терминация трансляции, а помеченный белок подвергается протеолизу [1]. Не до конца транслированный фрагмент мРНК при этом расщепляется нуклеазами.
Детальный механизм транс-трансляции в настоящее время исследуется.
Литература
- ↑ Gur E, Sauer RT (October 2008). «Evolution of the ssrA degradation tag in Mycoplasma: specificity switch to a different protease». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (42): 16113–8. DOI:10.1073/pnas.0808802105. PMID 18852454. Проверено 2010-07-14.
Ссылки
- tmRDB: A database of tmRNA sequences
- The tmRNA website
- Rfam entry for tmRNA
- Roche, ED; Sauer RT (1999). «SsrA-mediated peptide tagging caused by rare codons and tRNA scarcity.». EMBO J. 18(16): 4579-89. PMID 10449423.
Для улучшения этой статьи желательно?: - Добавить иллюстрации.
Типы нуклеиновых кислот Азотистые основания Нуклеозиды Нуклеотиды РНК мРНК • тРНК • рРНК • антисмысловые • gRNA • микро • некодирующие • piwi-interacting • shRNA • малые интерферирующие • малые ядерные • малые ядрышковые • тмРНК
ДНК кДНК • Геном • msDNA • Митохондриальная
Аналоги Гликоль-нуклеиновая кислота[ru] • Замкнутая нуклеиновая кислота[ru] • ПНК • ТНК • Морфолино
Типы векторов Фазмиды[ru] • Плазмиды • Фаг лямбда • Космиды[ru] • Фаг P1[ru] • Фосмиды[ru] • Искусственная бактериальная хромосома[ru] • Искусственная дрожжевая хромосома[ru] • Искусственная человеческая хромосома[ru]
Аминокислоты · Пептиды · Белки · Углеводы · Нуклеотиды · Нуклеиновая кислота · Липиды · Терпены · Каротиноиды · Стероиды · Флавоноиды · Алкалоиды · Гликозиды · Иридоиды
Категория:- РНК
Wikimedia Foundation. 2010.