NLRC4

NLRC4

Обозначения
Символы	NLRC4; CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, ipaf, CARD12
Entrez Gene	58484
HGNC	16412
OMIM	606831
RefSeq	NM_001199138
UniProt	Q9NPP4
Другие данные
Локус	2-я хр., 2p22 p21

NLRC4 (англ. NLR family, CARD domain containing 4) — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор из подсемейства NOD, продукт гена NLRC4. Ген клонирован в 2001 году. ^[1] Играет роль в активации апоптоза.

Функции

Играет роль в активации каспазы-1 в ответ на бактериальные патогены (липополисахарид, флагеллин, PrgJ).

Структура

Зрелый белок состоит из 1024 аминокислот, молекулярная масса — 116,2 кДа. Молекула включает CARD-домен, NACHT-домен с участком связывания АТФ и 14 LRR (лейцин-обогащённых)-повторов.

В результате альтернативного сплайсинга образуются 4 изоформы.

Взаимодействует через CARD-домены с ASC, NOD2, BCL10, NALP1, каспазой-1 и CARD15. ^[2]

Примечания

1. ↑ Damiano JS, Stehlik C, Pio F, Godzik A, Reed JC (July 2001). «CLAN, a novel human CED-4-like gene». Genomics 75 (1-3): 77–83. DOI:10.1006/geno.2001.6579. PMID 11472070.
2. ↑ UniProt Q9NPP4

Литература

• Kofoed EM, Vance RE (September 2011). «Innate immune recognition of bacterial ligands by NAIPs determines inflammasome specificity». Nature 477 (7366): 592–5. DOI:10.1038/nature10394. PMID 21874021.
• Poyet JL, Srinivasula SM, Tnani M, et al. (2001). «Identification of Ipaf, a human caspase-1-activating protein related to Apaf-1.». J. Biol. Chem. 276 (30): 28309–13. DOI:10.1074/jbc.C100250200. PMID 11390368.
• Damiano JS, Stehlik C, Pio F, et al. (2001). «CLAN, a novel human CED-4-like gene.». Genomics 75 (1-3): 77–83. DOI:10.1006/geno.2001.6579. PMID 11472070.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
• Fu WN, Bertoni F, Kelsey SM, et al. (2003). «Role of DNA methylation in the suppression of Apaf-1 protein in human leukaemia.». Oncogene 22 (3): 451–5. DOI:10.1038/sj.onc.1206147. PMID 12545166.
• Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). «The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment.». Genome Res. 13 (10): 2265–70. DOI:10.1101/gr.1293003. PMID 12975309.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Agostini L, Martinon F, Burns K, et al. (2004). «NALP3 forms an IL-1beta-processing inflammasome with increased activity in Muckle-Wells autoinflammatory disorder.». Immunity 20 (3): 319–25. DOI:10.1016/S1074-7613(04)00046-9. PMID 15030775.
• Damiano JS, Oliveira V, Welsh K, Reed JC (2004). «Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses.». Biochem. J. 381 (Pt 1): 213–9. DOI:10.1042/BJ20031506. PMID 15107016.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMID 15489334.
• Damiano JS, Newman RM, Reed JC (2004). «Multiple roles of CLAN (caspase-associated recruitment domain, leucine-rich repeat, and NAIP CIIA HET-E, and TP1-containing protein) in the mammalian innate immune response.». J. Immunol. 173 (10): 6338–45. PMID 15528373.
• Sadasivam S, Gupta S, Radha V, et al. (2005). «Caspase-1 activator Ipaf is a p53-inducible gene involved in apoptosis.». Oncogene 24 (4): 627–36. DOI:10.1038/sj.onc.1208201. PMID 15580302.
• Lu C, Wang A, Wang L, et al. (2005). «Nucleotide binding to CARD12 and its role in CARD12-mediated caspase-1 activation.». Biochem. Biophys. Res. Commun. 331 (4): 1114–9. DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.027. PMID 15882992.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). «Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network.». Nature 437 (7062): 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID 16189514.
• Thalappilly S, Sadasivam S, Radha V, Swarup G (2006). «Involvement of caspase 1 and its activator Ipaf upstream of mitochondrial events in apoptosis.». FEBS J. 273 (12): 2766–78. DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05293.x. PMID 16817903.