- ДНК-лигаза
-
Лигаза (лат. ligāre — сшивать, соединять) — фермент, катализирующий соединение двух молекул с образованием новой химической связи (лигирование). При этом обычно происходит отщепление (гидролиз) небольшой химической группы от одной из молекул.
Лигазы относятся к классу ферментов EC 6.
В молекулярной биологии лигазы (подкласс 6.5) разделяют на две большие группы — РНК-лигазы и ДНК-лигазы.
ДНК-лигазы
ДНК-лигазы — ферменты (EC 6.5.1.1), катализирующие ковалентное сшивание цепей ДНК в дуплексе при репликации, репарации и рекомбинации. Они образуют фосфодиэфирные мостики между 5'-фосфорильной и 3'-гидроксильной группами соседних дезоксинуклеотидов в местах разрыва ДНК или между двумя молекулами ДНК. Для образования этих мостиков лигазы используют энергию гидролиза пирофосфорильной связи АТФ. Один из самых распространённых коммерчески доступных ферментов — ДНК-лигаза бактериофага Т4.
ДНК-лигазы млекопитающих
У млекопитающих классифицируют четыре типа ДНК-лигаз.
- ДНК-лигаза I: лигирует Фрагменты Оказаки в ходе репликации отстающей цепи ДНК и некоторых фрагментов в ходе рекомбинации.
- ДНК-лигаза II: форма альтернативного сплайсинга ДНК-лигазы III, найденная в неделящихся клетках.
- ДНК-лигаза III: белковые комплексы с белком репарации ДНК en:XRCC1, образуются в ходе эксцизионной репарации оснований ДНК и при рекомбинации.
- ДНК-лигаза IV: образует комплкесы с en:XRCC4. Катализирует оконочательный этап негомологичного соединения концов (non-homologous end joining) двунитевых разрывов ДНК при соответстующем пути репарации. Также требуется для V(D)J рекомбинации генов иммуноглобулинов.
Репликация ДНК Ориджин репликации, DNA clamp - Фрагменты Оказаки - Репликационная вилка (Отстающая и лидирующая цепи) - Single-strand binding белки - Праймер - Процессивность - Фрагмент Кленова Пререпликационный комплекс: Хеликаза (dnaA, Праймаза ( ДНК лигаза - Теломераза - Топоизомераза
Wikimedia Foundation. 2010.