RasMol

RasMol

Тип	Биоинформатика
Разработчик	Herbert J. Bernstein
Написана на	C
Операционная система	Microsoft Windows, Linux, Apple Macintosh
Языки интерфейса	Английский, Русский
Последняя версия	2.7.5 (3 June 2009 (rev. 23 July 2009))
Лицензия	GNU General Public License
Сайт	http://www.rasmol.org/

Example of rendering by RasMol. TRAF2 trimer PDB:1DOA

RasMol — компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот. Первая версия программы RasMol была создана Роджером Сэйлом в начале 90-х годов.

Начиная с версий серии 2.7, RasMol распространяется по двойной лицензии (GPL или RASLIC). Тем самым, RasMol (наряду с Jmol и PyMOL) — одна из немногих программ визуализации молекул с открытым кодом.

RasMol остаётся лучшей из учебных программ визуализации молекул; кроме того, несмотря на наличие более сложных аналогов, продолжает активно использоваться молекулярными биологами и биоинформатиками. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд ("язык" RasMol'а) используется в других программах, например, в Jmol.

Исходными данными для визуализации служат координаты атомов молекулы (или комплекса молекул), содержащиеся в файле формата Protein Data Bank (PDB). Файлы с координатами атомов могут быть скопированы с одного из сайтов PDB (см. Worldwide Protein Data Bank).

Ссылки

Официальный сайт