Dicer

Молекула белка Dicer из Giardia intestinalis. Dicer катализирует разрезание двуцепочечной РНК (dsRNA), при этом образуются малые интерферирующие РНК (siRNA). Домены РНКазы III показаны зеленым цветом, домен PAZ показан желтым, домен платформы показан красным, соединительная спираль — синим цветом. Расстояние между доменами РНКазы III и PAZ определяется длиной соединительной петли и углом ее наклона, что, по-видимому, определяет длину образующихся молекул siRNA.^[1]

Dicer — рибонуклеаза из семейства RNase III (РНКазы III), которая разрезает двуцепочечную РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) в короткие двуцепочечные РНК фрагменты, называемые малыми интерферирующими РНК (siRNA, small interfering RNA) длиной приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3' конце.^[1]

Dicer содержит два домена RNase III и один PAZ домен. Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA.^[2]

См. также

• РНК-интерференция

Примечания

1. ↑ ^{1 2} Macrae I, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks A, Cande W, Adams P, Doudna J (2006). «Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer». Science 311 (5758): 195–8. DOI:10.1126/science.1121638. PMID 16410517.
2. ↑ Jaronczyk K, Carmichael J, Hobman T (2005). «Exploring the functions of RNA interference pathway proteins: some functions are more RISCy than others?». Biochem J 387 (Pt 3): 561–71. DOI:10.1042/BJ20041822. PMID 15845026.