Третичная структура белков

Разные способы изображения трёхмерной структуры белка на примере фермента триозофосфатизомеразы. Слева — «палочковая» модель, с изображением всех атомов и связей между ними; цветами показаны элементы. В середине изображены структурные мотивы, α-спирали и β-листы. Справа изображена контактная поверхность белка, построенная с учётом ван-дер-ваальсовых радиусов атомов; цветами показаны особенности активности участков

Третичная структура (или трехмерная структура ^[1])  — пространственное строение (включая конформацию) всей молекулы белка или другой макромолекулы, состоящей из единственной цепи^[2]. А также трехмерную форму полной молекулы белка называют третичной структурой белка ^[3].

Связь с первичной структурой

Третичная структура в значительной степени предопределена первичной структурой. Усилия по предсказанию третичной структуры белка основываясь на первичной структуре известна как задача предсказания структуры белка. Однако, окружающая среда, в которой белок сворачивается существенно определяет конечную форму, но обычно непосредственно не принимается во внимание текущими методами предсказания. Большинство таких методов полагаются на сравнения с уже известными структурами, и таким образом включают окружающую среду косвенно.

Третичная структура у белков

В стабилизации третичной структуры белка принимают участие:

• ковалентные связи (между двумя остатками цистеина — дисульфидные мостики);
• ионные связи между противоположно заряженными боковыми группами аминокислотных остатков;
• водородные связи;
• гидрофильно-гидрофобные взаимодействия. При взаимодействии с окружающими молекулами воды белковая молекула «стремится» свернуться так, чтобы неполярные боковые группы аминокислот оказались изолированы от водного раствора; на поверхности молекулы оказываются полярные гидрофильные боковые группы.

Третичная структура у РНК

Третичную структуру имеют также многие молекулы нуклеиновых кислот; в частности, универсальную третичную структуру имеют молекулы тРНК ^[4].

См. также

• Первичная структура
• Вторичная структура
• Четвертичная структура
• Парадокс Левинталя

Литература

• Кузнецова И. М., Форже В., Туроверов К. К. (2005). Структурная динамика, стабильность и фолдинг белков. Цитология, т. 47, № 11, с. 943—952. Текст

Примечания

1. ↑ Цитата: „The three-dimensional structure of proteins is often called tertiary structure“, /Трехмерную структуру белков часто называют третичной структурой/
   Karshikoff Andrey, «Non-covalent Interactions In Proteins», ISBN: 1860947077
2. ↑ tertiary structure // tertiary structure IUPAC Gold Book
3. ↑ What are macromolecular structures?
4. ↑ Строение транспортных РНК и их функция на первом (предрибосомном) этапе биосинтеза белков - ФАВОРОВА О.О