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Cette version dérivée de F-Zero GX, sorti sur GameCube, permet une connectivité avec ce dernier. Ainsi, grâce à un port dédié aux cartes mémoires GameCube, le joueur a la possibilité d'utiliser sa sauvegarde de F-Zero GX afin de piloter tous les vaisseaux débloqués et personnalisés du jeu dans la version AX. De même, les vaisseaux remportés sur la borne d'arcade peuvent être utilisés dans la version GX[1].