Гликозил-гидролазы


Гликозил-гидролазы
Модель молекулы гликозидазы с пространственной структурой в виде (β/α)8-бочонка
Модель молекулы гликозидазы с пространственной структурой в виде шести-лопастного β-пропеллера

Гликозил-гидролазы (или гликозидазы) катализируют гидролиз гликозидных связей в молекулах углеводов, приводя к появлению двух более мелких молекул углеводов. Эти ферменты встречаются в клетках почти всех живых организмов. Гликозидазы выполняют множество разнообразных функций: деградация биомассы (например, целлюлозы и гемицеллюлозы), участие в антибактериальной защите организма (например, лизоцим), развитие патогенеза (например, вирусные нейраминидазы), клеточный биосинтез (например, маннозидазы, вовлечённые в созревание N-гликозилированных гликопротеинов). Гликозидазы вместе с гликозилтрансферазами образуют основу биологического аппарата синтеза и разрушения гликозидных связей.

Классификация

Гликозил-гидролазы объединены в КФ 3.2.1 как ферменты, катализирующие гидролиз O- или S-гликозидов. Все гликозидазы имеют номера КФ 3.2.1.x, при этом x может быть от 1 до 165 в зависимости от субстратной специфичности фермента. На основе молекулярного механизма катализируемой ими реакции гликозидазы могут быть разбиты на две группы. Представители одной из них обращают (inverting), а другой — сохраняют (retaining) путём двойного обращения аномерную конфигурацию субстрата у продукта реакции гидролиза[1]. Гликозил-гидролазы также могут быть классифицированы как экзо- или эндо-действующие, в зависимости от того, действуют ли они соответственно на концевой или внутренний моносахаридный остаток в углеводной цепи. Более современные классификации гликозил-гидролаз основаны на сравнении их аминокислотных последовательностей. Такие классификации обладают большой предсказательной силой в отношении возможных биохимических активностей неисследованных ферментов с недавно определёнными последовательностями. Впервые классификация всех известных на тот момент последовательностей гликозидаз была предложена в 1991 году[2]. Близкородственные белки было предложено группировать в семейства. Впоследствии эволюционно родственные семейства стали объединять на более высоком иерархическом уровне в кланы[3]. Такая двухуровневая классификация в настоящее время доступна на сайте CAZy:

CAZy clans.jpg

Недавние исследования позволили на основе двухуровневой классификации создать многоуровневую (иерархическую) классификацию гликозил-гидролаз и их гомологов[4][5]:

GH classification.jpg

Номенклатура

Большинство гликозил-гидролаз получили свои названия по основному субстрату. Наряду с этими названиями часто также используются и названия, данные по отщепляемому углеводному остатку. Для ряда гликозил-гидролаз применяются тривиальные названия. Ниже для примера приведены названия некоторых гликозидаз и соответствующие К. Ф. номера:

Примечания

  1. Sinnott, M. L. Chem. Rev. 1990, 90, 1171—1202.
  2. Henrissat, B. Biochem. J. 1991, 280, 309—316.
  3. Henrissat, B., Bairoch, A. Biochem. J. 1996, 316, 695—696.
  4. Naumoff, D.G. Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 2006, 1, 294—298.
  5. Наумов Д.Г. Биохимия. 2011, 76, 764–780.



Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "Гликозил-гидролазы" в других словарях:

  • Гидролазы — (КФ3) это класс ферментов, катализирующий гидролиз ковалентной связи. Общий вид реакции, катализируемой гидролазой выглядит следующим образом: A–B + H2O → A–OH + B–H Номенклатура Систематическое название гидролаз включает название расщепляемого… …   Википедия

  • Карбогидраза — Модель молекулы гликозидазы с пространственной структурой в виде (β/α)8 бочонка Модель молекулы гликозидазы с пространственной структурой в виде шести лопастного β пропеллера Гликозил гидролазы (или гликозидазы) катализируют гидролиз гликозидных… …   Википедия

  • Карбогидразы — Модель молекулы гликозидазы с пространственной структурой в виде (β/α)8 бочонка Модель молекулы гликозидазы с пространственной структурой в виде шести лопастного β пропеллера Гликозил гидролазы (или гликозидазы) катализируют гидролиз гликозидных… …   Википедия

  • Альфа-галактозидаза — Мелибиазы (или α галактозидазы) (КФ 3.2.1.22)  гликозил гидролазы, способные отщеплять, как правило с сохранением их оптической конфигурации, терминальные нередуцирующие остатки α D галактозы от α D галактозидов, в том числе от… …   Википедия

  • Мелибиаза — Мелибиазы (или α галактозидазы) (К. Ф.3.2.1.22) гликозил гидролазы, способные отщеплять, как правило с сохранением их оптической конфигурации, терминальные нередуцирующие остатки α D галактозы от α D галактозидов, в том числе от… …   Википедия

  • Мелибиазы — (или α галактозидазы) (К. Ф.3.2.1.22) гликозил гидролазы, способные отщеплять, как правило с сохранением их оптической конфигурации, терминальные нередуцирующие остатки α D галактозы от α D галактозидов, в том числе от галактоолигосахаридов,… …   Википедия

  • Нейраминидаза — (КФ 3.2.1.18)  фермент, относящийся к гликозил гидролазам. Номенклатурное название  экзо α сиалидаза. Также употребимы названия: α нейраминидаза, N ацилнейраминидатгликогидролаза, сиалидаза. Катализируемые реакции: гидролиз α 2→3 , α… …   Википедия

  • Нейраминидазы — Нейраминидаза (КФ 3.2.1.18)  фермент, относящийся к гликозил гидролазам. Номенклатурное название  экзо α сиалидаза. Также употребимы названия: α нейраминидаза, N ацилнейраминидатгликогидролаза, сиалидаза. Катализируемые реакции: гидролиз α 2→3 ,… …   Википедия

  • Хитиназы — Хитиназа из семян ячменя Хитиназы (КФ 3.2.1.14)  это ферменты, катализирующие деградацию …   Википедия

  • Хитиназа — Хитиназы (КФ 3.2.1.14) это ферменты, катализирующие деградацию хитина, действующие наиболее часто как эндоферменты, отщепляя хитоолигосахариды длиной в 2 6 N ацетилглюкозаминовых остатков [1]. Хитиназы относятся к группе О гликозидных гидролаз,… …   Википедия


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»

We are using cookies for the best presentation of our site. Continuing to use this site, you agree with this.