HUGO Gene Nomenclature Committee

HUGO Gene Nomenclature Committee

HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) утверждает уникальные и значимые имена для всех известных человеческих генов[1] на основе опроса экспертов. В дополнение к длинным названием, HGNC также указывает аббревиатуру (называющуюся символом) для каждого гена. HGNC является частью международной организации по изучению генома человека(HUGO).


Содержание

Цель

Часто аббревиатуры и/или символы генов, а также полные имена генов не унифицированы для одного гена. Замечательным примером является CAP, который может относиться к любому из 6 различных генов (BRD4, CAP1, LNPEP, PTPLA, SERPINB6, and SORBS1).

Короткие имена гена или символы генов HGNC, в отличие от ранее использованных или опубликованных символов, относятся только к одному гену. Это может привести к использованию малоиспользуемой аббревиатуры, но уменьшает путаницу в том, к которому гену она относится.

Правила именования

HGNC резюмирует свой ​​подход к именованию генов и присвоению символов (сокращения имени гена) следующим образом:

  1. Генные символы должны быть уникальными
  2. Символы должны содержать только латинские буквы и арабские цифры
  3. Символы не должны содержать знаков препинания или «G» для обозначения гена
  4. Символы не содержит никаких ссылок на вид, для которого они закодированы, например «H/h» для человека

Полное описание принципов номенклатуры HGNC можно найти на веб-сайте [1]. HGNC вводит суффиксы _v1, _v2,.. для различия между вариантами сплайсинга _pr1, _pr2,.. для промоторов одного гена.

HGNC также утверждает, что «номенклатура генов должна развиваться в соответствии с новыми технологиями, а не быть ограничительной как это иногда происходит, когда применяются историческая и единая номенклатуры для наименования генов»[2]

Процедура наименования

При назначении номенклатуры для нового гена HGNC прилагает усилия, чтобы связаться с авторами, которые опубликовали работы о человеческом геноме, по электронной почте, и запрашивают предлагаемую номенклатуру. Для того чтобы работать своевременно, есть ограничение на срок в две недели для ответа, но срок может быть продлён. HGNC также координирует работу с соответствующими номенклатурными комитетами для мыши и крысы, другими кураторами баз данных и экспертами в данной конкретной семьи генов или наборов генов.

Редакция

Процедура пересмотра имени гена похожа на процедуру именования, но изменение стандартизированного названия гена после установления консенсуса может создать путаницу и достоинство этой процедуры достаточно спорно. По этой причине HGNC направлена ​​на изменение имени гена, только если получено согласие большинства исследователей, работающих над этим геном.

Примечания

Ссылки


Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "HUGO Gene Nomenclature Committee" в других словарях:

  • HUGO Gene Nomenclature Committee — The HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) approves a unique and meaningful name for every known human gene. In addition to the long name, the HGNC also assigns an abbreviation (referred to as symbol by HGNC) to every gene. The HGNC is part of… …   Wikipedia

  • Gene nomenclature — is the scientific naming of genes, the units of heredity in living organisms. An international committee published recommendations for genetic symbols and nomenclature in 1957. [Report of the International Committee on Genetic Symbols and… …   Wikipedia

  • Gene — For a non technical introduction to the topic, see Introduction to genetics. For other uses, see Gene (disambiguation). This stylistic diagram shows a gene in relation to the double helix structure of DNA and to a chromosome (right). The… …   Wikipedia

  • HUGO — Human Genome Organisation L Organisation du Génome Humain (The Human Genome Organisation), ou HUGO, est une organisation impliquée dans le projet génome humain, projet dont la mission est de séquencer totalement le génome de l être humain. HUGO a …   Wikipédia en Français

  • Gene Wiki — The Gene Wiki is a project that facilitates transferring information on human genes to Wikipedia article with the goal of promoting collaboration and expansion of the articles.cite journal | author = Huss JW, Orozco C, Goodale J, Wu C, Batalov S …   Wikipedia

  • Malat-Aspartat-Shuttle — Das Malat Aspartat Shuttle (Malat Zyklus), ist ein System zum indirekten Transfer des Reduktionsäquivalentes NADH vom Cytosol in die Matrix der Mitochondrien. Inhaltsverzeichnis 1 Funktionsweise 2 Biologische Bedeutung 3 Einordnung in den… …   Deutsch Wikipedia

  • Malat-Zyklus — Das Malat Aspartat Shuttle (Malat Zyklus), ist ein System zum indirekten Transfer des Reduktionsäquivalentes NADH vom Cytosol in die Matrix der Mitochondrien. Inhaltsverzeichnis 1 Funktionsweise 2 Biologische Bedeutung 3 Einordnung in den… …   Deutsch Wikipedia

  • Malat-shuttle — Das Malat Aspartat Shuttle (Malat Zyklus), ist ein System zum indirekten Transfer des Reduktionsäquivalentes NADH vom Cytosol in die Matrix der Mitochondrien. Inhaltsverzeichnis 1 Funktionsweise 2 Biologische Bedeutung 3 Einordnung in den… …   Deutsch Wikipedia

  • Malatschleuse — Das Malat Aspartat Shuttle (Malat Zyklus), ist ein System zum indirekten Transfer des Reduktionsäquivalentes NADH vom Cytosol in die Matrix der Mitochondrien. Inhaltsverzeichnis 1 Funktionsweise 2 Biologische Bedeutung 3 Einordnung in den… …   Deutsch Wikipedia

  • Malatzyklus — Das Malat Aspartat Shuttle (Malat Zyklus), ist ein System zum indirekten Transfer des Reduktionsäquivalentes NADH vom Cytosol in die Matrix der Mitochondrien. Inhaltsverzeichnis 1 Funktionsweise 2 Biologische Bedeutung 3 Einordnung in den… …   Deutsch Wikipedia


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»