Лигаза

Лигаза

Лигаза (лат. ligāre — сшивать, соединять) — фермент, катализирующий соединение двух молекул с образованием новой химической связи (лигирование[1][2]). При этом обычно происходит отщепление (гидролиз) небольшой химической группы от одной из молекул.

Лигазы относятся к классу ферментов EC 6.

В молекулярной биологии лигазы подкласса 6.5 классифицируют на РНК-лигазы и ДНК-лигазы.

Содержание

Классификация

  • КФ 6.1 включает лигазы, образующие связи между кислородом и углеродом
  • КФ 6.2 включает лигазы, образующие связи между серой и углеродом
  • КФ 6.3 включает лигазы, образующие связи между азотом и углеродом
  • КФ 6.4 включает лигазы, образующие связи между углеродом и углеродом
  • КФ 6.5 включает лигазы, образующие фосфодиэфирные связи
  • КФ 6.6 включает лигазы, образующие связи между азотом и металлами

ДНК-лигазы

ДНК-лигаза, осуществляющая репарацию ДНК

ДНК-лигазы — ферменты (EC 6.5.1.1), катализирующие ковалентное сшивание цепей ДНК в дуплексе при репликации, репарации и рекомбинации. Они образуют фосфодиэфирные мостики между 5'-фосфорильной и 3'-гидроксильной группами соседних дезоксинуклеотидов в местах разрыва ДНК или между двумя молекулами ДНК. Для образования этих мостиков лигазы используют энергию гидролиза пирофосфорильной связи АТФ. Один из самых распространённых коммерчески доступных ферментов — ДНК-лигаза бактериофага Т4.

ДНК-лигазы млекопитающих

У млекопитающих классифицируют три основных типа ДНК-лигаз.

  • ДНК-лигаза I лигирует фрагменты Оказаки в ходе репликации отстающей цепи ДНК и участвует в эксцизионной репарации[3].
  • ДНК-лигаза III в комплексе с белком XRCC1 участвует в эксцизионной репарации и в рекомбинации.
  • ДНК-лигаза IV в комплексе с XRCC4 катализирует окончательный этап негомологичного соединения (non-homologous end joining - NHEJ) двунитевых разрывов ДНК. Также требуется для V(D)J рекомбинации генов иммуноглобулинов.

Ранее выделяли ещё один тип лигаз - ДНК-лигазу II, которая позднее была признана артефактом выделения белков, а именно продуктом протеолиза ДНК-лигазы III[4].

Примечания

  1. Словарь биотехнологических терминов
  2. Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.
  3. Mortusewicz, O., Rothbauer, U., Cardoso, M. C., Leonhardt, H. Differential recruitment of DNA Ligase I and III to DNA repair sites. Nucleic acids research, 2006; 34(12), 3523-32. PMID 16855289
  4. Tomkinson, A. E., & Mackey, Z. B. Structure and function of mammalian DNA ligases. Mutation Research/DNA Repair; 1998; 407(1), 1-9. PMID 9539976



Wikimedia Foundation. 2010.

Игры ⚽ Нужно сделать НИР?
Синонимы:

Полезное


Смотреть что такое "Лигаза" в других словарях:

  • лигаза — синтегаза, синтетаза, фермент Словарь русских синонимов. лигаза сущ., кол во синонимов: 3 • синтегаза (2) • …   Словарь синонимов

  • лигаза — Фермент, восстанавливающий фосфодиэфирную связь в нуклеиновой кислоте [http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech Eng Rus.pdf] Тематики биотехнологии EN ligase …   Справочник технического переводчика

  • лигаза — ligazė statusas T sritis chemija apibrėžtis Fermentas, katalizuojantis kondensacijos (sintezės) reakcijas dalyvaujant didžiaenergiams junginiams. atitikmenys: angl. ligase; synthetase rus. лигаза; синтетаза ryšiai: sinonimas – sintetazė …   Chemijos terminų aiškinamasis žodynas

  • лигаза — ligazė statusas T sritis augalininkystė apibrėžtis Fermentas, katalizuojantis sintezės reakcijas, dalyvaujant didžiaenergiams junginiams. atitikmenys: angl. ligase; synthetase rus. лигаза; синтетаза …   Žemės ūkio augalų selekcijos ir sėklininkystės terminų žodynas

  • Лигаза синтетаза — Лигаза, синтетаза * лігаза, сінтэтаза * ligase or synthetase фермент, соединяющий разрыв в цепи ДНК путем образования фосфодиэфирной связи. Л. образует связи между С С, C S, C O и C N за счет энергии сопряженной реакции гидролиза (). Характерным… …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • ДНК-лигаза — Лигаза (лат. ligāre  сшивать, соединять)  фермент, катализирующий соединение двух молекул с образованием новой химической связи (лигирование). При этом обычно происходит отщепление (гидролиз) небольшой химической группы от одной из молекул.… …   Википедия

  • ДНК лигаза — Лигаза (лат. ligāre  сшивать, соединять)  фермент, катализирующий соединение двух молекул с образованием новой химической связи (лигирование). При этом обычно происходит отщепление (гидролиз) небольшой химической группы от одной из молекул.… …   Википедия

  • Убиквитин-лигаза — Участие убиквитин лигазы (Е3) в полиубиквитинизации белка мишени. Убиквитин лигаза (англ. E3 ubiquitin ligase) фермент лигаза, ковалентно присоединящий убиквитин к белку мишени изопептидной связью. Этот фермент является частью системы… …   Википедия

  • T4 ДНК-лигаза — * T4 ДНК лігаза * T4 DNA ligase фермент из T4 фагов, инфицирующих клетки E. coli, катализирующий образование фосфодиэфирной связи между рядом расположенными нуклеотидами в молекуле ДНК, у которых открыты 51 фосфаты и 31 гидроксильная группа.… …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • ДНК-лигаза — DNA lygase ДНК лигаза. Фермент, катализирующий образование фосфодиэфирной связи между 3’ гидроксилом и 5’ фосфатом соседних нуклеотидов в одноцепочечном разрыве полинуклеотидной цепи ДНК, участвует в процессах репликации <replication>,… …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»