Нуклеотидная последовательность


Нуклеотидная последовательность
Распечатка электрофореграммы, полученной с помощью автоматического секвенатора

Нуклеотидная последовательность, генетическая последовательность  — порядок следования нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. Определяется при помощи секвенирования.

Для записи нуклеотидных последовательностей ДНК по рекомендации IUPAC используются символы латинского алфавита.[1]

  • A = аденин[2]
  • C = цитозин
  • G = гуанин
  • T = тимин
  • R = G A гуанин или аденин — пуриновые (purine) основания
  • Y = T C пиримидиновые (pyrimidine) основания
  • K = G T содержащие кето-группу
  • M = A C содержащие аминогруппу
  • S = G C «сильные» (strong), образующие 3 водородные связи
  • W = A T «слабые» (weak), образующие 2 водородные связи
  • B = G T C (любой, кроме A)
  • D = G A T (любой, кроме C)
  • H = A C T (любой, кроме G)
  • V = G C A (любой, кроме T)
  • N = A G C T (любой)

Cимволы, обозначающие неопределённость последовательности, необходимы, когда точная последовательность неизвестна, несущественна, или известны разные ее варианты.

Для записи последовательностей РНК обычно достаточно символов A, С, G, U (уридин).

Все последовательности записываются без пробелов, слева направо, от 5'-конца к 3'-концу.

Примечания

  1. Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences, NC-IUB, 1984.
  2. для удобства используются названия оснований, а не нуклеозидов

См. также



Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "Нуклеотидная последовательность" в других словарях:

  • нуклеотидная последовательность — Порядок расположения нуклеотидов в молекуле нуклеиновой кислоты. [Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.] Тематики генетика EN base sequence …   Справочник технического переводчика

  • нуклеотидная последовательность — base sequence нуклеотидная последовательность. Порядок расположения нуклеотидов в молекуле нуклеиновой кислоты. (Источник: «Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В.А., Лисовенко Л.А., Москва: Изд во ВНИРО, 1995 г.) …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • повторяющаяся нуклеотидная последовательность — repetitious DNA повторяющаяся нуклеотидная последовательность (ДНК). Последовательность нуклеотидов, содержащаяся в хромосомной ДНК в виде идентичных копий; на основании кинетики реассоциации ДНК различают высокоповторяющиеся нуклеотидные… …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • повторяющаяся нуклеотидная последовательность (ДНК) — Последовательность нуклеотидов, содержащаяся в хромосомной ДНК в виде идентичных копий; на основании кинетики реассоциации ДНК различают высокоповторяющиеся нуклеотидные последовательности (млн. копий на геном), а также умеренно повторяющиеся… …   Справочник технического переводчика

  • усредненная последовательность — canonical sequence каноническая (усредненная) последовательность. Aминокислотная или нуклеотидная последовательность, принимаемая за эталон в сравнительном анализе; также К.п. некая идеальная (усредненная) последовательность, каждая позиция в… …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • каноническая (усредненная) последовательность — Аминокислотная или нуклеотидная последовательность, принимаемая за эталон в сравнительном анализе; также К.п. некая идеальная (усредненная) последовательность, каждая позиция в которой представлена нуклеотидом (или аминокислотой), наиболее часто… …   Справочник технического переводчика

  • Консенсусная последовательность — * кансенсусная паслядоўнасць * consensus sequence определенная нуклеотидная последовательность, регулярно встречающаяся (с небольшими вариациями по отдельным нуклеотидам) в данном генетическом элементе (напр., в промоторе). Обычно такие… …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • PBR322 — Карта плазмиды pBR 322 pBR322 плазмида, используемая в бактериях E. coli как вектор клонирования. Создана в 1977 году мексиканскими биологами …   Википедия

  • ТРАНСПОРТНЫЕ РИБОНУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ — (тРНК, трансферные РНК, адапторные РНК), низкомолекулярные РНК, осуществляющие перенос аминокислотных остатков к матричной РНК (мРНК) при трансляции (синтезе полипептидяой цепи на мРНК матрице в рибосомах). Присутствуют в цитоплазме и… …   Химическая энциклопедия

  • ГЕН — (от греч. genos род, происхождение), наследственный фа ктор, функционально неделимая единица генетич. материала; участок молекулы ДНК (у нек рых вирусов РНК), кодирующий первичную структуру полипептида, молекулы транспортной или ри босомальной… …   Биологический энциклопедический словарь


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»

We are using cookies for the best presentation of our site. Continuing to use this site, you agree with this.