Бактериородопсин


Бактериородопсин
1m0l opm.gif
Тример бактериородопсина
Обозначения в базах данных
Pfam PF01036
InterPro IPR001425
PROSITE PDOC00291
SCOP 2brd
TCDB 3.E.1
OPM family 6
OPM protein 1vgo

Бактериородопсины — семейство мембранных светочувствительных белков археот (например, галобактерий). Бактериородопсины осуществляют перенос протона через плазматическую мембрану, по строению сходны с родопсинами млекопитающих.

Содержание

Состав белка

Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных \alpha-спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая \beta-шпилька и все нерегулярные участки цепи (соединяющие спирали-петли) выходят из мембраны. Сидящие на \alpha-спиралях гидрофобные группы обращенны «наружу» к липидам (тоже гидрофобным) мембраны. Полярные же группы (их немного) обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.

Процесс переноса протона через мембрану

Протонная проводимость осуществляется при содействии прикрепленной внутри пучка спиралей молекулы кофактора — ретиналя. Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон, ретиналь переходит из полностью-транс в 13-цис форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.

Литература

  • А. В. Финкельштейн, О. Б. Птицын, «Физика белка», 2002

См. также


Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "Бактериородопсин" в других словарях:

  • бактериородопсин — бактериородопсин …   Орфографический словарь-справочник

  • БАКТЕРИОРОДОПСИН — мембранный белок галофильных бактерий рода (Halobacterium). Как и зрит, пигмент сетчатки глаза, Б. содержит ретиналь, но в другой конфигурации. Находится в клетках в т. н. пурпурных мембранах, выполняя функцию протонного насоса, преобразующего… …   Биологический энциклопедический словарь

  • бактериородопсин — мембранный белок галофильных архей (галобактерий) рода Halobacterium. Подобно зрительному пигменту сетчатки глаза, Б. содержит ретиналь, но в другой конфигурации. Находится в клетках в так называемых пурпурных мембранах, выполняя функцию… …   Словарь микробиологии

  • бактериородопсин — сущ., кол во синонимов: 1 • белок (99) Словарь синонимов ASIS. В.Н. Тришин. 2013 …   Словарь синонимов

  • бактериородопсин —  Bacteriorhodopsin  Бактериородопсин   Мембранный белок, обнаруженный в морской архебактерии Halobacterium halobium. Присутствует в специализированных бляшках бактериальной цитоплазматической мембраны, называемой пурпурной мембраной, образуя там… …   Толковый англо-русский словарь по нанотехнологии. - М.

  • БАКТЕРИОРОДОПСИН — мембранный белок микроорганизмов класса Галобактериум галобиум (Halobacterium halobium), живущих в соленых озерах и солончаках. Мол. м. ок. 26 тыс. Состоит из 248 аминокислотных остатков. Небелковая часть молекулы (простетич. группа) соединена с… …   Химическая энциклопедия

  • Бактериородопсин-содержащие пленки — Бактериородопсинсодержащие плёнки  наноплёнки, полученные с использованием пурпурных мембран галобактерий, содержащих бактериородопсин. Используются в качестве компонента в биомолекулярной электронике. Содержание 1 Изготовление 2… …   Википедия

  • Оптические нейронные сети — реализация искусственных нейронных сетей в виде оптических систем. Для обеспечения параллелизма в цифровом компьютере необходима параллельная работа многих элементов. Занимаемое ими пространство, с учетом пространства, необходимого для изоляции… …   Википедия

  • Археи — Halobacteria, штамм NRC 1, каждая клетка около 5 мкм длиной …   Википедия

  • Галобактерии — Научная классификация …   Википедия