GAMESS (US)


GAMESS (US)

GAMESS (US) — программа пакета вычислительной квантовой химии.[1][2][3] Аббревиатура расшифровывается как General Atomic and Molecular Electronic Structure System. В 1981 году появилось две стабильных ветви GAMESS: GAMESS (US) и GAMESS (UK), с тех пор их развитие шло самостоятельно и на сегодняшний день эти две программы отличаются довольно существенно. Проект GAMESS поддерживается членами исследовательской группы Гордона в Государственном Университете штата Айова.

Содержание

Возможности

Суммарная таблица по ряду основных возможностей GAMESS
(C - хранение интегралов, D - прямые вычисления интегралов АО, p - параллельное исполнение, F - использование фрагентарных МО)
SCFTYP= RHF ROHF UHF GVB MCSCF
Энергия CDpF CDp CDp CDp CDpF
Аналитический градиент CDpF CDp CDp CDp CDpF
Численный Гессиан CDpF CDp CDp CDp CDp
Аналитический Гессиан CDp CDp - CDp CDp
MP2 энергия CDpF CDp CDp - CDp
MP2 градиент CDpF Dp CDp - -
CI энергия CDp CDp - CDp CDp
CI градиент CD - - - -
CC энергия CDpF - - - -
EOM энергия CD - - - -
DFT энергия CDpF CDp CDp - -
DFT градиент CDpF CDp CDp - -
MOPAC энергия yes yes yes yes -
MOPAC градиент yes yes yes - -

GAMESS (US) способен производить расчеты МО при помощи многих методов вычислительной квантовой химии, включая метод Хартри-Фока, теорию функционала плотности (DFT), теория валентных связей (GVB), и многоконфигурационное самосогласованное поле (MCSCF). Коррекция энергии электронной корреляции после процедуры самосогласования может быть осуществлена при помощи конфигурационного взаимодействия (CI), теории возмущений Меллера-Плессета второго порядка. Эффект растворителя может учитываться в рамках моделей SCRF, PCM или моделироваться с помощью, т.н. "эффективных фрагментов". Релятивистские поправки также могут быть учтены с помощью различных методов, например приближением Дугласа-Кролла третьего порядка.

Поскольку в программе молекулярная механика не реализована, комбинированные расчеты используют пакет TINKER для вычислений механической части. Метод фрагментарных МО может использоваться для расчета крупных систем, деля их на "фрагменты".

Связь с другими программами

GAMESS сохраняет расчет в текстовый файл специального формата. Хранящиеся в данном файле координаты могут быть преобразованы программой OpenBabel. Молекулярные орбитали можно визуализировать такими программами, как Molekel (англ. Molekel) или wxMacMolPlt.

Совместимость и доступность

US GAMESS работает на всех POSIX-совместимых операционных системах, OS X и Windows. На официальном сайте доступны бинарные пакеты для Mac OS X, MacOS 7-9 и Microsoft Windows. Также поддерживаются платформы Sun Solaris UltraSPARC/x86/x86-64, IBM BlueGene, AIX POWER/PowerPC, Linux x86/x86-64, Cray X1/XT Unicos, Fujitsu PrimePower Solaris, HP PA-RISC/x86 HP-UX и NEC SUPER-UX[4].

Исходный код US GAMESS распространяется бесплатно при условии некоммерческого использования программы.

См. также

Примечания

  1. Computational Chemistry, David Young, Wiley-Interscience, 2001. Appendix A. A.2.3 pg 334, GAMESS
  2. M.W. Schmidt et al. (1993). «General Atomic and Molecular Electronic Structure System». J. Comput. Chem. 14: 1347–1363. DOI:10.1002/jcc.540141112.
  3. M. S. Gordon and M. W. Schmidt, Advances in electronic structure theory: GAMESS a decade later, in Theory and Applications of Computational Chemistry, the first 40 years, C. E. Dykstra, G. Frenking. K. S. Lim and G. E. Scusaria, Elsevier, Amsterdam, 2005.
  4. GAMESS Registration: download

Внешние ссылки


Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "GAMESS (US)" в других словарях:

  • GAMESS — steht für General Atomic Molecular and Electronic Structure System und ist die Bezeichnung für ein Softwarepaket zur Verwendung in der Quantenchemie. Nachdem dessen Entwicklung in den 1980er Jahren in die beiden Zweige GAMESS (UK) und GAMESS (US) …   Deutsch Wikipedia

  • GAMESS (US) — is a computational chemistry software program that stands for General Atomic and Molecular Electronic Structure System. [ Computational Chemistry , David Young, Wiley Interscience, 2001. Appendix A. A.2.3 pg 334, GAMESS ] [ cite… …   Wikipedia

  • GAMESS (UK) — is a computational chemistry software program that stands for General Atomic and Molecular Electronic Structure System. The original code split in 1981 into GAMESS (US) and GAMESS (UK) variants, which now differ significantly. Many of the early… …   Wikipedia

  • GAMESS (UK) — GAMESS steht für General Atomic Molecular and Electronic Structure System und ist die Bezeichnung für ein Softwarepaket zur Verwendung in der Quantenchemie. Nachdem die Entwicklung von GAMESS in den 1980er Jahren in die beiden Zweige GAMESS (UK)… …   Deutsch Wikipedia

  • GAMESS — is a computational chemistry software program and stands for General Atomic and Molecular Electronic Structure System. The original code of GAMESS split in 1981 and now the three version differ considerably:* GAMESS (US) * GAMESS (UK) * PC GAMESS …   Wikipedia

  • GAMESS (US) — Bei GAMESS (US) handelt es sich um ein umfangreiches Software Paket für die Computerchemie, das von Mark Gordon an der Iowa State University entwickelt wurde und auch bis heute betreut wird. Es ist nicht zu verwechseln mit GAMESS (UK), das seit… …   Deutsch Wikipedia

  • PC GAMESS — PC GAMESS/Firefly is an ab initio computational chemistry program for Intel compatible x86, x86 64 processors based on GAMESS (US) sources. However, it has mostly been rewritten (about 60 70% of the code), especially in platform specific parts… …   Wikipedia

  • PC GAMESS — / Firefly  программный пакет для ab initio квантовохимических расчётов. Работает на Intel совместимых процессорах архитектур x86 и x86 64 (только 32 битная версия). Основана на коде пакета программ GAMESS (US). Автором было переписано 60… …   Википедия

  • Firefly (программа) — У этого термина существуют и другие значения, см. Firefly. Firefly (ранее известен как PC GAMESS)   программный пакет для ab initio квантовохимических расчётов. Работает на Intel совместимых процессорах архитектур x86 и x86 64 (только 32… …   Википедия

  • Fragment molecular orbital — The fragment molecular orbital method (FMO) is a computational method that can compute very large molecular systems with thousands of atoms using ab initio quantum chemical wave functions. Introduction The fragment molecular orbital method (FMO)… …   Wikipedia