- GAMESS (US)
-
GAMESS (US) — программа пакета вычислительной квантовой химии.[1][2][3] Аббревиатура расшифровывается как General Atomic and Molecular Electronic Structure System. В 1981 году появилось две стабильных ветви GAMESS: GAMESS (US) и GAMESS (UK), с тех пор их развитие шло самостоятельно и на сегодняшний день эти две программы отличаются довольно существенно. Проект GAMESS поддерживается членами исследовательской группы Гордона в Государственном Университете штата Айова.
Содержание
Возможности
Суммарная таблица по ряду основных возможностей GAMESS
(C - хранение интегралов, D - прямые вычисления интегралов АО, p - параллельное исполнение, F - использование фрагентарных МО)SCFTYP= RHF ROHF UHF GVB MCSCF Энергия CDpF CDp CDp CDp CDpF Аналитический градиент CDpF CDp CDp CDp CDpF Численный Гессиан CDpF CDp CDp CDp CDp Аналитический Гессиан CDp CDp - CDp CDp MP2 энергия CDpF CDp CDp - CDp MP2 градиент CDpF Dp CDp - - CI энергия CDp CDp - CDp CDp CI градиент CD - - - - CC энергия CDpF - - - - EOM энергия CD - - - - DFT энергия CDpF CDp CDp - - DFT градиент CDpF CDp CDp - - MOPAC энергия yes yes yes yes - MOPAC градиент yes yes yes - - GAMESS (US) способен производить расчеты МО при помощи многих методов вычислительной квантовой химии, включая метод Хартри-Фока, теорию функционала плотности (DFT), теория валентных связей (GVB), и многоконфигурационное самосогласованное поле (MCSCF). Коррекция энергии электронной корреляции после процедуры самосогласования может быть осуществлена при помощи конфигурационного взаимодействия (CI), теории возмущений Меллера-Плессета второго порядка. Эффект растворителя может учитываться в рамках моделей SCRF, PCM или моделироваться с помощью, т.н. "эффективных фрагментов". Релятивистские поправки также могут быть учтены с помощью различных методов, например приближением Дугласа-Кролла третьего порядка.
Поскольку в программе молекулярная механика не реализована, комбинированные расчеты используют пакет TINKER для вычислений механической части. Метод фрагментарных МО может использоваться для расчета крупных систем, деля их на "фрагменты".
Связь с другими программами
GAMESS сохраняет расчет в текстовый файл специального формата. Хранящиеся в данном файле координаты могут быть преобразованы программой OpenBabel. Молекулярные орбитали можно визуализировать такими программами, как Molekel (англ. Molekel) или wxMacMolPlt.
Совместимость и доступность
US GAMESS работает на всех POSIX-совместимых операционных системах, OS X и Windows. На официальном сайте доступны бинарные пакеты для Mac OS X, MacOS 7-9 и Microsoft Windows. Также поддерживаются платформы Sun Solaris UltraSPARC/x86/x86-64, IBM BlueGene, AIX POWER/PowerPC, Linux x86/x86-64, Cray X1/XT Unicos, Fujitsu PrimePower Solaris, HP PA-RISC/x86 HP-UX и NEC SUPER-UX[4].
Исходный код US GAMESS распространяется бесплатно при условии некоммерческого использования программы.
См. также
- GAMESS (UK)
- PC GAMESS
Примечания
- ↑ Computational Chemistry, David Young, Wiley-Interscience, 2001. Appendix A. A.2.3 pg 334, GAMESS
- ↑ M.W. Schmidt et al. (1993). «General Atomic and Molecular Electronic Structure System». J. Comput. Chem. 14: 1347–1363. DOI:10.1002/jcc.540141112.
- ↑ M. S. Gordon and M. W. Schmidt, Advances in electronic structure theory: GAMESS a decade later, in Theory and Applications of Computational Chemistry, the first 40 years, C. E. Dykstra, G. Frenking. K. S. Lim and G. E. Scusaria, Elsevier, Amsterdam, 2005.
- ↑ GAMESS Registration: download
Внешние ссылки
- GAMESS-US Homepage (англ.)
- GAMESS Google Group
- Gamess (рус.) — описание на русском
- Jan Jensen's blog with some GAMESS tutorials
- wxMacMolPlot software page
Категория:- Программное обеспечение вычислительной химии
Wikimedia Foundation. 2010.
