ДНК-микрочип


ДНК-микрочип
Термин
ДНК-микрочип
Термин на английском
DNA microarray
Синонимы
ДНК-чип, DNA chip, Gene сhip, DNA chip
Аббревиатуры
Связанные термины
биосенсор, геном, ДНК, ДНК-зонд, лаборатория на чипе, РНК, олигонуклеотид
Определение

Миниатюрная пластина с нанесенными на нее в определенном порядке фрагментами ДНК известной последовательности для проведения генетического анализа.

Описание

ДНК-микрочип – устройство, созданное по аналогии с электронными микросхемами (чипами), предназначенное для одновременного выявления множества определенных последовательностей ДНК. ДНК-микрочип используется для изучения экспрессии генов и поиска мутаций в биомедицинских исследованиях. Микрочип изготавливается из стекла, силикона или пластика. ДНК наносится на него методом машинной микропечати и химической пришивки в виде множества упорядоченных точек, каждая из которых содержит равное количество синтезированных ДНК-фрагментов,  имеющих уникальную последовательность. В других технологиях гибридизационного анализа генов комплементарные фрагменты ДНК пришивают к поверхности микроскопических шариков. Современные ДНК-микрочипы могут одновременно измерить экспрессию десятков тысяч генов у человека и выявить около миллиона мутаций. Принцип работы микрочипа для изучения экспрессии генов состоит в следующем. Активная работа гена в данной ткани выражается в накоплении его матричной РНК (мРНК). Все мРНК экстрагируются из образца ткани, и с помощью фермента обратной транскриптазы на них синтезируется т.н. комплементарная ДНК (кДНК), которая значительно устойчивей и удобней в работе, чем мРНК. Полученный набор кДНК метят с помощью флуоресцентных или радиоизотопных меток. Содержание индивидуальных кДНК в образце прямо пропорционально содержанию их мРНК-матриц и, следовательно, уровню активности соответствующих генов. Смесь кДНК наносят на микрочип, в каждой точке которого пришиты ДНК-фрагменты, соответствующие кодирующей последовательности одного из генов. кДНК находят «свои» точки и связываются (гибридизуются) с ними по принципу комплементарности. Чем больше в растворе кДНК данного вида, тем больше ее прикрепляется к своей точке. Затем специальное сканирующее устройство определяет содержание кДНК в каждой точке микрочипа, а программа соотносит его с названием гена, представленного данной точкой. Результатом ДНК-микрочипового исследования является матрица из точек, интенсивность которых прямо пропорциональна активности соответствующих генов. 

Авторы
  • Народицкий Борис Савельевич, д.б.н.
  • Ширинский Владимир Павлович, д.б.н.
  • Нестеренко Людмила Николаевна, к.б.н.
Ссылки
  1. DNA Chip Technology / Office of Science Education and Outreach: Research Technique Fact Sheets URL: http://www.genome.gov/DIR/VIP/Learning_Tools/Fact_Sheets/dna_chip.html (дата обращения 12.10.2009)
  2. Ke Y., Stuart L., Yung C., Yan L., Hao Y. Self-assembled water-soluble nucleic acid probe tiles for label-free RNA hybridization assays.// Science – № 5860 (319), 2008 – P.180-183
Иллюстрации
Микрочип для 40000 проб, в котором каждая точка отображена псевдоцветом в соответствии с уровнем экс

Микрочип для 40000 проб, в котором каждая точка отображена псевдоцветом в соответствии с уровнем экспрессии соответствующего ей гена.


Источник: Wikipedia, the free encyclopedia. URL: http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/0/0e/Microarray2.gif (дата обращения 12.10.2009)

Теги
Разделы
Диагностические методы с применением фиксированных наноструктур
Выделение и иммобилизация биологических веществ с применением наноматериалов
Молекулярное распознавание c применением наноматериалов
Биологические методы, основанные на амплификации
Люминесцентная микроскопия
Зондовые методы микроскопии и спектроскопии: атомно-силовая, сканирующая туннельная, магнитно-силовая и др.
Формирование наноматериалов с использованием биологических систем и/или методов
Иммобилизация мицелл и биологических нанообъектов
Методы, основанные на специфических взаимодействиях биологических молекул
Бионанотехнологии
Сенсоры на основе наноструктур и наноматериалов
Нанотехнологии и наноматериалы в медицине (диагностика, системы доставки лекарств, эксипиенты, восстановление тканей и органов, другое)
Бионанотехнологии, биофункциональные наноматериалы и наноразмерные биомолекулярные устройства
Методы диагностики и исследования наноструктур и наноматериалов
Методы формирования наноматериалов
Управляемые методы формирования наноструктур
Методы нанесения элементов наноструктур и наноматериалов
Бионаноматериалы и биофункционализированные наноматериалы
Элементы или наборы элементов, контролируемо модифицированные функциональными молекулами, мицеллами или биологическими объектами субмикронных размеров
Наноматериалы
Наноструктуры
Продукты нанотехнологий
Получение, диагностика и сертификация наноразмерных систем
Технология
Наука

Энциклопедический словарь нанотехнологий. — Роснано. 2010.

Смотреть что такое "ДНК-микрочип" в других словарях:

  • ДНК-микрочип — Микрочип для 40000 проб ДНК микрочип (англ. DNA microarray)  это сложная технология, используемая в молекулярной биологии и медицине. ДНК мик …   Википедия

  • ДНК-зонд — Термин ДНК зонд Термин на английском DNA probe Синонимы Аббревиатуры Связанные термины биологические нанообъекты, биомедицинские микроэлектромеханические системы, биосенсор, геном, ДНК, ДНК микрочип, лаборатория на чипе, олигонуклеотид… …   Энциклопедический словарь нанотехнологий

  • ДНК — Термин ДНК Термин на английском DNA Синонимы дезоксирибонуклеиновая кислота Аббревиатуры ДНК Связанные термины доставка генов, актуатор, бактериофаг, белки, биологические нанообъекты, биомиметика, биомиметические наноматериалы, генная инженерия,… …   Энциклопедический словарь нанотехнологий

  • ДНК-чип —  DNA Chip  ДНК чип (также: ДНК биочип, ДНК микрочип, ДНК наночип)   Специальный чип, используемый для выявления генетических мутаций или сдвигов, диагностики заболеваний.    Биочип для американской армии, разработанный специалистами из… …   Толковый англо-русский словарь по нанотехнологии. - М.

  • ДНК-биочип —  DNA Chip  ДНК чип (также: ДНК биочип, ДНК микрочип, ДНК наночип)   Специальный чип, используемый для выявления генетических мутаций или сдвигов, диагностики заболеваний.    Биочип для американской армии, разработанный специалистами из… …   Толковый англо-русский словарь по нанотехнологии. - М.

  • Микрочип генный м микроматрица — Микрочип, генный м., микроматрица * мікрачып, генны м., мікраматрыца * microarray or gene chip or microchip набор из тысяч уникальных известных однонитевых фрагментов ДНК, иммобилизированных на твердую основу. Эти фрагменты представляют все… …   Генетика. Энциклопедический словарь

  • Саузерн, Эдвин — Сэр Эдвин Мэллор Саузерн (р. 7 июня 1938)  английский молекулярный биолог, член лондонского королевского общества по развитию знаний о природе (также известного как лондонское королевское общество), лауреат премии Ласкера (2005). Премия была …   Википедия

  • КДНК — ДНК микрочип, содержащий комплементарные ДНК. Комплементарная ДНК (кДНК, англ. сDNA)  это ДНК, синтезированная из зрелой мРНК в реакции, катализируемой обратной транскриптазой. кДНК ча …   Википедия

  • Количественный анализ нуклеиновых кислот — Количественный анализ нуклеиновых кислот  определение концентрации ДНК или РНК в смеси или чистом препарате. Реакции с участием нуклеиновых кислот часто требуют точных сведений о количестве и чистоте препарата. Для определения концентрации… …   Википедия

  • амплификация — Термин амплификация Термин на английском amplification Синонимы Аббревиатуры Связанные термины Определение (лат. amplificatio усиление, увеличение), в молекулярной биологии увеличение числа копий ДНК. Описание В клетке амплификация происходит в… …   Энциклопедический словарь нанотехнологий


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»

We are using cookies for the best presentation of our site. Continuing to use this site, you agree with this.