основные группы прокариот

основные группы прокариот

В сокращенном виде представлены два варианта классификации прокариот в соответствии с последними изданиями руководства Берджи по идентификации [Определитель бактерий Берджи. В 2 т. / Пер. с англ.; Под ред. Дж. Хоулта Н. Крига, П. Снита, Дж. Стейли и С. Уильямса., 9–е изд., М., 1997.] (1) и систематике [Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: 2–nd Ed. Vol. 1. Ed. D. R. Boone, R. W. Castenholz: Springer–Verlag, N. Y., Berlin, Heidelberg, 2001.] (2) бактерий.

 

1 Грамотрицательные бактерии
ГРУППА 1. Спирохеты (Borrelia, Spirochaeta, Treponema[В скобках указаны названия нескольких характерных родов.])

 

ГРУППА 2. Аэробные/микроаэрофильные, подвижные, спиральные/ изогнутые грамотрицательные бактерии (Aquaspirillum, Bdello–vibrio, Helicobacter)

 

ГРУППА 3. Неподвижные (или редко – подвижные) грамотрицательные изогнутые бактерии (Ancylobacter, Spirosoma)

 

ГРУППА 4. Грамотрицательные, аэробные/микроаэрофильные палочки и кокки
ПОДГРУППА 1 (Agrobacterium, Azotobacter, Bradyrhizobium, Methy–lobacterium, Paracoccus, Rhizobium, Zoogloea)
ПОДГРУППА 2 (Taylorella, Wolinella)

 

ГРУППА 5. Факультативно анаэробные грамотрицательные палочки
ПОДГРУППА 1. Семейство Enterobacteriaceae (Klebsiella, Proteus, Salmonella)
ПОДГРУППА 2. Семейство Vibrionaceae (Aeromonas, Vibrio)
ПОДГРУППА 3. Семейство Pasteurellaceae (Pasteurella)
ПОДГРУППА 4. Другие роды

 

ГРУППА 6. Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые и спиральные бактерии (Acetogenium, Bacteroides, Fusobacterium, Selenomonas)
ГРУППА 7. Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серы
ПОДГРУППА 1 (Desulfotomaculum)
ПОДГРУППА 2 (Desulfomicrobium, Desulfovibrio)
ПОДГРУППА 3 (Desulfobacter, Desulfococcus, Desulfonema)
ПОДГРУППА 4 (Desulfurella, Desulfuromonas)

 

ГРУППА 8. Анаэробные грамотрицательные кокки (Syntrophococcus, Yeillonella)

 

ГРУППА 9. Риккетсии и хламидии (Rickettsia, Chlamydia)

 

ГРУППА 10. Аноксигенные фототрофные бактерии
ПОДГРУППА 1 (Chromatium, Thiocapsa, Thiospirillum)
ПОДГРУППА 2 (Ectothiorhodospira)
ПОДГРУППА 3 (Rhodobacter, Rhodopseudomonas, Rhodospirillum)
ПОДГРУППА 4 (Heliobacillus, Heliobacterium)
ПОДГРУППА 5 (Chlorobium, Prosthecochloris)
ПОДГРУППА 6 (Chloroflexus)
ПОДГРУППА 7 (Erythrobacter)

 

ГРУППА 11. Оксигенные фототрофные бактерии
I. Цианобактерии
ПОДГРУППА 1 (Порядок Chroococcales: Synechococcus)
ПОДГРУППА 2 (Порядок Pleurocapsales: Dermocarpa)
ПОДГРУППА 3 (Порядок Oscillatoriales: Oscillatoria, Spirulina)
ПОДГРУППА 4 (Порядок Nostocales: Anabaena, Nostoc, Calothrix)
ПОДГРУППА 5 (Порядок Stigonematales: Fischerella, Stigonema)
II. Прохлорофиты (Порядок Prochlorales: Prochloron, Prochlorothrix)

 

ГРУППА 12. Аэробные хемолитотрофные бактерии и родственные им организмы
ПОДГРУППА 1. Бесцветные сероокисляющие бактерии (Thiobacillus)
ПОДГРУППА 2. Железо–и марганецокисляющие и/или осаждающие бактерии (Gallionella, Metallogenium, Siderocapsa)
ПОДГРУППА 3. Нитрифицирующие бактерии (Nitrobacter, Nitro–coccus, Nitrosomonas, Nitrosospira)

 

ГРУППА 13. Почкующиеся и/или обладающие выростами бактерии
ПОДГРУППА 1. Простекобактерии (Caulobacter, Hyphomicrobium)
ПОДГРУППА 2. Порядок Planctomycetales (Planctomyces)
ПОДГРУППА 3. Другие почкующиеся и/или обладающие выростами бактерии (Nevskia, Seliberia)

 

ГРУППА 14. Бактерии, обладающие чехлом (Leptothrix, Sphaerotilus)

 

ГРУППА 15. Нефотосинтезирующие, не образующие плодовых тел скользящие бактерии
ПОДГРУППА 1. Одноклеточные палочковидные скользящие бактерии (Cytophaga, Flexibacter)
ПОДГРУППА 2. Плоские нитчатые скользящие бактерии (Alysiella, Simonsiella)
ПОДГРУППА 3. Сероокисляющие скользящие бактерии (Achromatium, Beggiatoa)
ПОДГРУППА 4. Пелонемы («Pelonema», «Peloploca»)

 

ГРУППА 16. Скользящие бактерии, образующие плодовые тела: мик–собактерии (Chondromyces, Myxococcus, Polyangium)
Грамположительные бактерии

 

ГРУППА 17. Грамположительные кокки (Leuconostoc, Micrococcus, Staphylococcus)

 

ГРУППА 18. Грамположительные палочки и кокки, образующие эндоспоры (Bacillus, Clostridium, Sulfobacillus)

 

ГРУППА 19. Грамположительные неспорообразующие палочки правильной формы (Caryophanon, Lactobacillus)

 

ГРУППА 20. Грамположительные неспорообразующие палочки неправильной формы (Arthrobacter, Bifidobacterium, Propionibacterium)

 

ГРУППА 21. Микобактерии (Mycobacterium)

 

ГРУППЫ 22–29. Актиномицеты
ГРУППА 22. Нокардиоформные актиномицеты
ПОДГРУППА 1. Бактерии, содержащие миколовые кислоты (No–cardia, Rhodococcus)
ПОДГРУППА 2. Pseudonocardia и близкие роды
ПОДГРУППА 3. Nocardioides и Terrabacter
ПОДГРУППА 4. Promicromonospora и близкие роды

 

ГРУППА 23. Роды с многогнездными спорангиями (Frankia)

 

ГРУППА 24. Актинопланы (Actinoplanes)

 

ГРУППА 25. Стрептомицеты и близкие роды (Streptomyces)

 

ГРУППА 26. Мадуромицеты
ПОДГРУППА 1. Streptosporangium и родственные таксоны
ПОДГРУППА 2. Actinomadura

 

ГРУППА 27. Thermomonospora и близкие роды

 

ГРУППА 28. Термоактиномицеты (Thermoactinomyces)

 

ГРУППА 29. Другие роды

 

Микоплазмы
ГРУППА 30. Микоплазмы (или молликуты): бактерии без клеточной стенки (Mycoplasma)

 

Архебактерии (археи)
ГРУППА 31. Метаногены
ПОДГРУППА 1 (Methanobacterium)
ПОДГРУППА 2 (Methanococcus)
ПОДГРУППА 3 (Methanosarcina)

 

ГРУППА 32. Сульфатредуцирующие археи (Archaeoglobus)

 

ГРУППА 33. Экстремально галофильные аэробные архебактерии (галобактерии) (Halobacterium, Halococcus, Natronococcus)

 

ГРУППА 34. Архебактерии, лишенные клеточной стенки (Thermoplasma)

 

ГРУППА 35. Экстремальные термофилы и гипертермофилы, метаболизирующие S
ПОДГРУППА 1 (Acidianus, Sulfolobus)
ПОДГРУППА 2 (Pyrobaculum, Thermoproteus)
ПОДГРУППА 3 (Desulfurococcus, Pyrodictium, Thermococcus)

 

2 Домен Archaea
ФИЛА [Фила (филум, филогенетическая линия) в определенной степени соответствует отделу.] А1 Crenarchaeota
КЛАСС 1 Thermoprotei (Thermoproteus, Sulfolobus, Acidianus)

 

ФИЛА А2 Euryarchaeota
КЛАСС 1 Methanobacteria (Methanobacterium)
КЛАСС 2 Methanococci (Methanococcus, Methanosarcina)
КЛАСС 3 Halobacteria (Halobacterium, Natronobacterium)
КЛАСС 4 Thermoplasmata (Thermoplasma)
КЛАСС 5 Thermococci (Thermococcus)
КЛАСС 6 Archaeoglobi (Archaeoglobus)
КЛАСС 7 Methanopyri (Methanopyrus)

 

Домен Bacteria
ФИЛА B1 Aquificae
КЛАСС 1 Aquificae (Aquifex)

 

ФИЛА В2 Thermotogae
КЛАСС 1 Thermotogae (Thermotoga)

 

ФИЛА В3 Thermodesulfobacteria
КЛАСС 1 Thermodesulfobacteria (Thermodesulfobacterium)

 

ФИЛА В4 «Deinococcus–Thermus» [В кавычках приводятся таксономические названия, не получившие до настоящего времени официального статуса в соответствии с Международным кодексом номенклатуры бактерий.]
КЛАСС 1 Deinococci (Deinococcus, Thermus)

 

ФИЛА В5 Chrysiogenetes
КЛАСС 1 Chrysiogenetes (Chrysiogenes)

 

ФИЛА В6 Chloroflexi
КЛАСС 1 «Chloroflexi» (Chloroflexus)

 

ФИЛА В7 Thermomicrobia
КЛАСС 1 Thermomicrobia (Thermomicrobium)

 

ФИЛА В8 Nitrospirae
КЛАСС 1 «Nitrospira» (Nitrospira, Leptospirillum)

 

ФИЛА В9 Deferribacteres
КЛАСС 1 Deferribacteres (Deferribacter)

 

ФИЛА В10 Cyanobacteria
КЛАСС 1 «Cyanobacteria» (Microcystis, Prochloron, Pleurocapsa, Oscillatoria, Nostoc, Stigonema)

 

ФИЛА В11 Chlorobi
КЛАСС 1 «Chlorobia» (Chlorobium)

 

ФИЛА В12 Proteobacteria
КЛАСС 1 «Alphaproteobacteria» (Rhodospirillum, Azospirillum, Rickettsia, Paracoccus, Sphingomonas, Caulobacter, Rhizobium, Nitrobacter, Rhodopseudomonas, Hyphomicrobium)
КЛАСС 2 «Betaproteobacteria» (Alcaligenes, Thiobacillus, Nitrosomo–nas, Zoogloea)
КЛАСС 3 «Gammaproteobacteria» (Chromatium, Ectothiorhodospira, Beggiatoa, Legionella, Pseudomonas, Azotobacter, Vibrio, Escherichia, Proteus, Salmonella)
КЛАСС 4 «Deltaproteobacteria» (Desulfurella, Desulfovibrio, Bdello–vibrio, Myxococcus)
КЛАСС 5 «Epsilonproteobacteria» (Helicobacter, Wolinella)

 

ФИЛА В13 Firmicutes
КЛАСС 1 «Clostridia» (Clostridium, Desulfotomaculum)
КЛАСС 2 Mollicutes (Mycoplasma)
КЛАСС 3 «Bacilli» (Bacillus, Lactobacillus)

 

ФИЛА В14 Actinobacteria
КЛАСС 1 Actinobacteriaceae (Micrococcus, Arthrobacter, Mycobacterium, Nocardia, Streptomyces, Frankia, Bifidobacterium)

 

ФИЛА В15 Planctomycetes
КЛАСС 1 «Planctomycetacia» (Planctomyces)

 

ФИЛА В14 Chlamydiae
КЛАСС 1 «Chlamydiae» (Chlamydia)

 

ФИЛА В17 Spirochaetes
КЛАСС 1 «Spirochaetes» (Spirochaeta)

 

ФИЛА В18 Fibrobacteres
КЛАСС 1 «Fibrobacteres» (Fibrobacter)

 

ФИЛА В19 Acidobacteria
КЛАСС 1 «Acidobacteria» (Acidobacterium)

 

ФИЛА В20 Bacteroidetes
КЛАСС 1 «Bacteroides» (Bacteroides)
КЛАСС 2 «Flavobacteria» (Flavobacterium)
КЛАСС 3 Sphingobacteria (Sphingobacterium, Flexibacter, Cytophaga)

 

ФИЛА В21 Fusobacteria
КЛАСС 1 «Fusobacteria» (Fusobacterium)

 

ФИЛА В22 Verrucomicrobia
КЛАСС 1 Verrucomicrobiae (Verrucomicrobium)

 

ФИЛА В23 Dictyoglomi
КЛАСС 1 «Dictyoglomi» (Dictyoglomus)

(Источник: «Микробиология: словарь терминов», Фирсов Н.Н., М: Дрофа, 2006 г.)