КФ это:

КФ

Шифр КФ (Классификация ферментов) или код фермента — это классификационный номер фермента по международной иерархической классификации. Принятая система классифицирует ферменты по группам и индексирует индивидуальные ферменты, что важно для стандартизации исследований.

Классификация ферментов основана и периодически обновляется Комиссией по ферментам (англ. Enzyme commission, отсюда термин «EC number», принятый в англоязычной литературе) при Международном союзе биохимии и молекулярной биологии. Каждый шифр КФ ассоциирован также с рекомендованным названием соответствующего фермента. Классифицировано более 3500 ферментов.

Содержание

Принцип классификации

Классификация ферментов учитывает реакционную и субстратную специфичности ферментов, а не их белковую структуру. Шифр КФ определяет химическую реакцию, катализируемую ферментом. По этой причине аналогичные ферменты (иногда десятки) из различных организмов имеют один КФ, несмотря на структурные различия.

Иногда различные ферменты одного организма имеют один КФ. Например, панкреатическая липаза и печёночная липаза принадлежат обе к КФ 3.1.1.3 благодаря катализированию одной химической реакции (гидролиз эфирной связи в триглицериде), хотя первый фермент является ферментом пищеварения и работает в кишечнике, а второй относится к ферментам обмена липопротеинов в крови.

Существует база данных UniProt [1] , которая идентифицирует каждый белок по его первичной последовательности. Обе базы данных дополняют друг друга.

Формат шифра

Каждый классификационный номер содержит сокращение КФ и последовательность из четырёх чисел, разделённых точкой, и составляется по определенному принципу. Каждое последующее число представляет собой всё более и более уточняющую классификацию фермента. Так как база данных постоянно обновляется коды могут меняться и некоторые коды могут оставаться незаполненными.

Класс

  • Код первого уровня (первое число, может быть от 1 до 6) указывает номер одного из шести главных классов ферментов (см. таблицу Коды первого уровня).

Подкласс

  • Код второго уровня (второе число) означает подкласс, характеризующий основные виды субстратов, участвующих в данном типе химических реакций. Например, у трансфераз вторая цифра указывает на природу той группы, которая подвергается переносу, у гидролаз — на тип гидролизуемой связи и т. д.

Под-подкласс

  • Код третьего уровня (третье число) определяет более частные подгруппы (под-подклассы), отличающиеся природой химических соединений доноров или акцепторов, участвующих в данной подгруппе реакций. У гидролаз, например, эта цифра уточняет тип гидролизуемой связи, а у лиаз — тип отщепляемой группы и т. д. Первые 3 числа шифра точно определяют тип фермента.

Код четвертого уровня

Наконец, все ферменты, относящиеся к данному под-подклассу, получают свой порядковый номер (четвёртое число в шифре).

КФ 1 — Оксидоредуктазы
КФ 1.1 — Алкогольоксидоредуктазы
КФ 1.1.3 — Оксидоредуктазы, окисляющие группу CH-OH и восстанавливающие кислород.
КФ 1.1.3.4 — Оксидоредуктазы, окисляющие глюкозу в присутствие кислорода. Всего известно 3 глюкозоксидазы из разных организмов.

Коды первого уровня

Класс Катализируемая реакция Тип реакции Важнейшие подклассы
КФ 1
Оксидоредуктазы
Окислительно-восстановительные реакции. Перенос атомов H и O или электронов от одного субстрата на другой AH + B → A + BH (восстановленный)
A + O → AO (окисленный)
дегидрогеназа, оксидаза, пероксидаза, редуктаза, монооксидаза, диоксигеназа
КФ 2
Трансферазы
Перенос функциональной группы от одного субстрата на другой. Это может быть метильная, ацильная, фосфатная группа или аминогруппа. AB + C → A + BC аминотрансфераза, фосфотрансфераза, C1-трансфераза, гликозилтрансфераза
КФ 3
Гидролазы
Образование двух продуктов из одного субстрата в результате гидролиза. AB + H2O → AOH + BH эстераза, гликозил-гидролаза, пептидаза, амидаза
КФ 4
Лиазы (синтазы)
Негидролитическое добавление или удаление группы к или от субстрата. Образование C-C, C-N, C-O или C-S связи. RCOCOOH → RCOH + CO2 C-O-лиаза, C-S-лиаза, C-N-лиаза, C-C-лиаза
КФ 5
Изомеразы
Внутримолекулярная перестановка, то есть изомеризация молекулы субстрата. AB → BA эпимераза, цис-транс-изомераза, внутримолекулярная оксидоредуктаза и др.
КФ 6
Лигазы (синтетазы)
Соединение двух молекул в результате синтеза новой C-O, C-S, C-N или C-C связи, сопряжённое с одновременным гидролизом АТФ. X + Y+ ATP → XY + ADP + Pi C-O-лигаза, C-S-лигаза, C-N-лигаза, C-C-лигаза

История

Схема номенклатуры ферментов была впервые разработана в 1955 году, когда Международный конгресс биохимии в Брюсселе учредил Комиссию по ферментам (Enzyme Commission). Первая версия номенклатуры появилась в 1961 году и включала около 900 ферментов, в версии 1978 года было более 2000 ферментов. Версия 1995 года содержит более 3500 ферментов.

Ссылки

  1. ENZYME (Enzyme nomenclature database). ExPASy. Проверено 14 марта 2006.

См.также

Шаблон:Ферменты


Wikimedia Foundation. 2010.

Смотреть что такое "КФ" в других словарях:

  • КФ — КФ. См. классификация ферментов. (Источник: «Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В.А., Лисовенко Л.А., Москва: Изд во ВНИРО, 1995 г.) …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • КФ — комфлот комфлота КФ КФл командующий флотом КФ Словарь: С. Фадеев. Словарь сокращений современного русского языка. С. Пб.: Политехника, 1997. 527 с. КФ кумилфенол Источник: http://chem.kstu.ru/jchem&cs/russian/n4/appl4/yal2000/0sdms112/0sdms112.htm… …   Словарь сокращений и аббревиатур

  • КФ — канавокопатель фрезерный командующий флотом Комитет фармации креатинфосфат культиватор фрезерный (в маркировке) культиватор фрезерный …   Словарь сокращений русского языка

  • КФ ВУ РХБЗ — КФ ВУРХБЗ Костромской филиал ВУ РХБЗ после: КВВКИУ РХБЗ биол., воен., г. Кострома, образование и наука, хим …   Словарь сокращений и аббревиатур

  • КФ ВУРХБЗ — КФ ВУ РХБЗ КФ ВУРХБЗ Костромской филиал ВУ РХБЗ после: КВВКИУ РХБЗ биол., воен., г. Кострома, образование и наука, хим …   Словарь сокращений и аббревиатур

  • КФ МСХА — Калужский филиал Московской сельскохозяйственной академиии имени К. А. Тимирязева г. Калуга, Москва, образование и наука …   Словарь сокращений и аббревиатур

  • КФ СЗАГС — Карельский филиал Северо Западной академии государственной службы http://gosacad.karelia.ru/​ Карелия, образование и наука …   Словарь сокращений и аббревиатур

  • КФ ТИГ ДВО РАН — Камчатский филиал Тихоокеанского института географии Дальневосточного отделения Российской академии наук; Камчатский филиал ФГБУН Тихоокеанского института географии ДВО РАН http://www.kftig.com/​ геогр., Камчатская обл., образование и наука …   Словарь сокращений и аббревиатур

  • КФ МГТУ — Калужский филиал Московского государственного технического университета имени Н. Э. Баумана http://bmstu.kaluga.ru/​ г. Калуга, Москва, образование и наука, техн …   Словарь сокращений и аббревиатур

  • КФ ПетрГУ — Кольский филиал Петрозаводского Государственного университета г. Апатиты http://www.arcticsu.ru г. Петрозаводск, Мурманская обл., образование и наука …   Словарь сокращений и аббревиатур

Книги

  • Агент КФ, Кир Булычев. Это истории о приключениях человека, который не любил приключений. Истории о подвигах героя, ненавидевшего геройство. Истории о космических странствиях легендарного агента КФ — Андрея Брюса,… Подробнее  Купить за 500 руб
  • Агент КФ, Кир Булычев. Персонажи произведений Кира Булычева, живущие и действующие в фантастическом мире будущего, - обыкновенные люди, обладающие как достоинствами, так и недостатками,сильными и слабыми чертами… Подробнее  Купить за 400 руб
  • Агент КФ, Булычев Кир. Эта книга первая из дилогии об агенте Космофлота Андрее Брюсе. Время действия — далекое будущее. Судьба забрасывает умного и отважного агента на планету Пэ-У, там происходят ужасные события.… Подробнее  Купить за 266 руб
Другие книги по запросу «КФ» >>

Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»