КФ

КФ

Шифр КФ (Классификация ферментов) или код фермента — это классификационный номер фермента по международной иерархической классификации. Принятая система классифицирует ферменты по группам и индексирует индивидуальные ферменты, что важно для стандартизации исследований.

Классификация ферментов основана и периодически обновляется Комиссией по ферментам (англ. Enzyme commission, отсюда термин «EC number», принятый в англоязычной литературе) при Международном союзе биохимии и молекулярной биологии. Каждый шифр КФ ассоциирован также с рекомендованным названием соответствующего фермента. Классифицировано более 3500 ферментов.

Содержание

Принцип классификации

Классификация ферментов учитывает реакционную и субстратную специфичности ферментов, а не их белковую структуру. Шифр КФ определяет химическую реакцию, катализируемую ферментом. По этой причине аналогичные ферменты (иногда десятки) из различных организмов имеют один КФ, несмотря на структурные различия.

Иногда различные ферменты одного организма имеют один КФ. Например, панкреатическая липаза и печёночная липаза принадлежат обе к КФ 3.1.1.3 благодаря катализированию одной химической реакции (гидролиз эфирной связи в триглицериде), хотя первый фермент является ферментом пищеварения и работает в кишечнике, а второй относится к ферментам обмена липопротеинов в крови.

Существует база данных UniProt [1] , которая идентифицирует каждый белок по его первичной последовательности. Обе базы данных дополняют друг друга.

Формат шифра

Каждый классификационный номер содержит сокращение КФ и последовательность из четырёх чисел, разделённых точкой, и составляется по определенному принципу. Каждое последующее число представляет собой всё более и более уточняющую классификацию фермента. Так как база данных постоянно обновляется коды могут меняться и некоторые коды могут оставаться незаполненными.

Класс

  • Код первого уровня (первое число, может быть от 1 до 6) указывает номер одного из шести главных классов ферментов (см. таблицу Коды первого уровня).

Подкласс

  • Код второго уровня (второе число) означает подкласс, характеризующий основные виды субстратов, участвующих в данном типе химических реакций. Например, у трансфераз вторая цифра указывает на природу той группы, которая подвергается переносу, у гидролаз — на тип гидролизуемой связи и т. д.

Под-подкласс

  • Код третьего уровня (третье число) определяет более частные подгруппы (под-подклассы), отличающиеся природой химических соединений доноров или акцепторов, участвующих в данной подгруппе реакций. У гидролаз, например, эта цифра уточняет тип гидролизуемой связи, а у лиаз — тип отщепляемой группы и т. д. Первые 3 числа шифра точно определяют тип фермента.

Код четвертого уровня

Наконец, все ферменты, относящиеся к данному под-подклассу, получают свой порядковый номер (четвёртое число в шифре).

КФ 1 — Оксидоредуктазы
КФ 1.1 — Алкогольоксидоредуктазы
КФ 1.1.3 — Оксидоредуктазы, окисляющие группу CH-OH и восстанавливающие кислород.
КФ 1.1.3.4 — Оксидоредуктазы, окисляющие глюкозу в присутствие кислорода. Всего известно 3 глюкозоксидазы из разных организмов.

Коды первого уровня

Класс Катализируемая реакция Тип реакции Важнейшие подклассы
КФ 1
Оксидоредуктазы
Окислительно-восстановительные реакции. Перенос атомов H и O или электронов от одного субстрата на другой AH + B → A + BH (восстановленный)
A + O → AO (окисленный)
дегидрогеназа, оксидаза, пероксидаза, редуктаза, монооксидаза, диоксигеназа
КФ 2
Трансферазы
Перенос функциональной группы от одного субстрата на другой. Это может быть метильная, ацильная, фосфатная группа или аминогруппа. AB + C → A + BC аминотрансфераза, фосфотрансфераза, C1-трансфераза, гликозилтрансфераза
КФ 3
Гидролазы
Образование двух продуктов из одного субстрата в результате гидролиза. AB + H2O → AOH + BH эстераза, гликозил-гидролаза, пептидаза, амидаза
КФ 4
Лиазы (синтазы)
Негидролитическое добавление или удаление группы к или от субстрата. Образование C-C, C-N, C-O или C-S связи. RCOCOOH → RCOH + CO2 C-O-лиаза, C-S-лиаза, C-N-лиаза, C-C-лиаза
КФ 5
Изомеразы
Внутримолекулярная перестановка, то есть изомеризация молекулы субстрата. AB → BA эпимераза, цис-транс-изомераза, внутримолекулярная оксидоредуктаза и др.
КФ 6
Лигазы (синтетазы)
Соединение двух молекул в результате синтеза новой C-O, C-S, C-N или C-C связи, сопряжённое с одновременным гидролизом АТФ. X + Y+ ATP → XY + ADP + Pi C-O-лигаза, C-S-лигаза, C-N-лигаза, C-C-лигаза

История

Схема номенклатуры ферментов была впервые разработана в 1955 году, когда Международный конгресс биохимии в Брюсселе учредил Комиссию по ферментам (Enzyme Commission). Первая версия номенклатуры появилась в 1961 году и включала около 900 ферментов, в версии 1978 года было более 2000 ферментов. Версия 1995 года содержит более 3500 ферментов.

Ссылки

  1. ENZYME (Enzyme nomenclature database). ExPASy. Проверено 14 марта 2006.

См.также

Шаблон:Ферменты


Wikimedia Foundation. 2010.

См. также в других словарях:

  • КФ — КФ. См. классификация ферментов. (Источник: «Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В.А., Лисовенко Л.А., Москва: Изд во ВНИРО, 1995 г.) …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • КФ — канавокопатель фрезерный командующий флотом Комитет фармации креатинфосфат культиватор фрезерный (в маркировке) культиватор фрезерный …   Словарь сокращений русского языка

  • КФ-ХТ-П — По своему вешниму виду КФ ХТ П представляет собой суспензию однородного белого цвета, хотя зачистую цвет может варьироваться от белого до светло коричневого цвета в зависимости от дополнительных включений и срока ее хранения. КФ ХТ П… …   Википедия

  • Шифр КФ — (Классификация ферментов) или код фермента  это классификационный номер фермента по международной иерархической классификации. Принятая система классифицирует ферменты по группам и индексирует индивидуальные ферменты, что важно для… …   Википедия

  • сорбитолдегидрогеназа [КФ 1 — sorbitol dehydrogenase, L iditol dehydrogenase сорбитолдегидрогеназа [КФ 1. 1.1.14]. Локализованный в клетках печени фермент, окисляющий 6 атомный спирт сорбит до D фруктозы, которая затем может включаться в процесс гликолиза. (Источник: «Англо… …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

  • Академии бюджета и казначейства Министерства финансов России (КФ АБиК МФ РФ) — …   Википедия

  • ВС КФ ЧРИ — Кавказский фронт Вооружённых сил ЧРИ организационное объединение исламистских боевых террористических групп на Северном Кавказе (Россия) за пределами чеченской территории, учреждённое указом президента самопровозглашённой Чеченской Республики… …   Википедия

  • Дыхтау Главная по центральному контрфорсу Южной стены 5А к. тр. (по левому КФ?) — Дыхтау Главная по центральному контрфорсу Южной стены 5А к. тр., Дыхтау Восточная по Южному ребру 5А к. тр. Исходный бивуак на осыпной полке по основание контрфорса. От альплагеря до «Австрийских ночевок» и далее по карману между склонами и… …   Энциклопедия туриста

  • Дыхтау по Южному ребру (по правому КФ) 5А к. тр. — 1 ый день От альплагеря Безенги путь идет вверх по тропе, по правой (орографически) морене ледника Безенги до Миссес Коша. В южном конце поляны Миссес Кош следует спуститься на ледник и двигаться вверх по нему, придерживаясь середины, менее… …   Энциклопедия туриста

  • Доломит (С) 3686 4а по правому кф. З стены — Маршруты на Доломит (С) Назад Категория: Узункольские 4А …   Энциклопедия туриста

Книги

  • Агент КФ, Кир Булычев. Персонажи произведений Кира Булычева, живущие и действующие в фантастическом мире будущего, - обыкновенные люди, обладающие как достоинствами, так и недостатками,сильными и слабыми чертами… Подробнее  Купить за 504 руб
  • Агент КФ, Булычев Кир. Эта книга первая из дилогии об агенте Космофлота Андрее Брюсе. Время действия - далекое будущее. Судьба забрасывает умного и отважного агента на планету Пэ-У, там происходят ужасные события.… Подробнее  Купить за 219 руб
  • Агент КФ, Булычев Кир. Эта книга первая из дилогии об агенте Космофлота Андрее Брюсе. Время действия — далекое будущее. Судьба забрасывает умного и отважного агента на планету Пэ-У, там происходят ужасные события.… Подробнее  Купить за 209 руб
Другие книги по запросу «КФ» >>

Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»