Серпин

Серпины (англ. Serpins, сокращение от serine protease inhibitor) — группа белков, которые имеют определённое структурное сходство между собой и многие из которых ингибируют сериновые протеазы, то есть протеазы, имеющие серин в активном центре.

Введение

Изначально этим термином обозначали класс белков, специфически ингибирующие определённые сериновые протеазы (например, антитромбин — серпин, специфически ингибирующий сериновую протеазу тромбин). Однако позже оказалось, что некоторые белки, структурно сходные с серпинами, не обладают ингибиторной активностью (например, основной белок яичного белка овальбумин), но тем не менее они также отнесены к серпинам.

Классификация

В 2001 году был опубликована классификация серпинов, по которой 500 белков, отнесённых к серпинам, были разделены на 16 кладов (групп, возникших из одного предшественника). См. (Silverman et al.) в Библиографии.

Основные представители класса

Следующие белки относятся к классу серпинов:

• Сериновые протеазы:
  • Альфа-антитрипсин;
  • Альфа-антихимотрипсин;
  • Альфа-антиплазмин (ингибитор фибринолиза);
  • Антитромбин (ингибитор коагуляции, в частности фактора X, фактора IX и тромбина;
  • C1-ингибитор;
  • Нейросерпин;
  • Ингибитор активатора плазминогена-1 и Ингибитор активатора плазминогена-2 (ингибитор фибринолиза);
  • Ингибитор белок Z-подобной протеазы (ZPI, инактивирует фактор X и фактор XI)

• Связывающие глобулины и другие белки:
  • Транскортин
  • Тироксин-связывающий глобулин
  • Ангиотензин
  • Овальбумин

Библиография

• Silverman GA, Bird PI, Carrell RW, Church FC, Coughlin PB, Gettins PG, Irving JA, Lomas DA, Luke CJ, Moyer RW, Pemberton PA, Remold-O'Donnell E, Salvesen GS, Travis J, Whisstock JC. The serpins are an expanding superfamily of structurally similar but functionally diverse proteins. Evolution, mechanism of inhibition, novel functions, and a revised nomenclature. J Biol Chem 2001;276:33293-6. PMID 11435447.
• Gettins PGW. Serpin structure, mechanism and function. Chem Rev 2002;102:4751-803. DOI 10.1021/cr010170+.
• Irving JA, Steenbakkers PJ, Lesk AM, Op den Camp HJ, Pike RN, Whisstock JC. Serpins in prokaryotes. Mol Biol Evol. 2002 Nov;19(11):1881-90. PMID 12411597.
• Irving JA, Pike RN, Lesk AM, Whisstock. Phylogeny of the Serpin Superfamily: Implications of Patterns of Amino Acid Conservation for Structure and Function. Genome Res. 2000; 10; 1845-64. PMID 11116082.