shRNA

shRNA

Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (англ. shRNA, short hairpin RNA, small hairpin RNA) — молекулы коротких рибонуклеиновых кислот, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии генов путем РНК-интерференции. Короткие РНК, образующие шпильки, вводят в клетки при помощи вектора, использующего промотор U6, для обеспечения конститутивной экспрессии. Такой вектор, как правило, передается дочерним клеткам и обеспечивает наследуемое выключения гена.[1]

Структура малых РНК, образующих шпильки, разрезается клеточными ферментами в малые интерферирующие РНК (siRNA), которые далее переходят в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RISC). Этот комплекс связывается и разрезает мРНК, участки которых комплементарны siRNA.

Малые РНК, образующие шпильки, транскрибируются РНК полимеразой III. Образование shRNA в клетках млекопитающих иногда вызывает интерфероновый ответ, для защиты клетки, как в случае вирусной атаки. Такие процессы не наблюдаются в случае miRNA (микроРНК), которые транскрибируются РНК полимеразой II.[2]

Малые РНК, образующие шпильки, также используются и у растений. но в таком случае, не используют промотор U6. В растениях обычно используют традиционный промотор, обеспечивающий конститутивную экспрессию, — CaMV35S из вируса мозаики цветной капусты (англ. cauliflower mosaic virus 35S promoter).[3]

Примечания

  1. ↑ Paddison P, Caudy A, Bernstein E, Hannon G, Conklin D (2002). «Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells». Genes Dev. 16 (8): 948–58. DOI:10.1101/gad.981002. PMID 11959843.
  2. ↑ Cao W, Hunter R, Strnatka D, McQueen C, Erickson R (2005). «DNA constructs designed to produce short hairpin, interfering RNAs in transgenic mice sometimes show early lethality and an interferon response». J. Appl. Genet. 46 (2): 217–25. PMID 15876690.
  3. ↑ McIntyre G, Fanning G (2006). «Design and cloning strategies for constructing shRNA expression vectors». BMC Biotechnol. 6: 1. DOI:10.1186/1472-6750-6-1. PMID 16396676.


Цинковый палец

Wikimedia Foundation. 2010.

Игры ⚽ Нужно сделать НИР?

Полезное


Смотреть что такое "shRNA" в других словарях:

  • ShRNA — Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (англ. shRNA, short hairpin RNA, small hairpin RNA)  молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения… …   Википедия

  • ShRNA — Unter RNA Interferenz (RNAi, auch RNA Silencing) versteht man einen natürlichen Mechanismus in eukaryotischen Zellen, der die Genexpression einzelner Gene hemmt. Bei dieser Genregulation ist immer RNA als zielerkennendes Molekül beteiligt. Nach… …   Deutsch Wikipedia

  • shRNA — short hairpin RNA …   Medical dictionary

  • shRNA — • short hairpin RNA …   Dictionary of medical acronyms & abbreviations

  • Small hairpin RNA — A small hairpin RNA or short hairpin RNA (shRNA) is a sequence of RNA that makes a tight hairpin turn that can be used to silence gene expression via RNA interference. shRNA uses a vector introduced into cells and utilizes the U6 promoter to… …   Wikipedia

  • The RNAi Consortium — NOTOC The RNAi Consortium, or TRC, is a public private partnership whose mission is to create libraries of small hairpin RNAs (shRNAs) for 15 000 human and 15 000 mouse genes. These libraries should help the scientific community to analyse gene… …   Wikipedia

  • Short hairpin RNA — Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA  short hairpin RNA, small hairpin RNA)  молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии… …   Википедия

  • Small hairpin RNA — Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA  short hairpin RNA, small hairpin RNA)  молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии… …   Википедия

  • Малые РНК, образующие шпильки — Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA  short hairpin RNA, small hairpin RNA)  молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии… …   Википедия

  • Lentivirus — Virus classification Group: Group VI (ssRNA RT) Family: Retroviridae Subfamily: Orthoretrovirinae …   Wikipedia


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
… Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»