IARP

International Aging Research Portfolio
URL:	www.agingportfolio.org
Коммерческий:	Нет
Тип сайта:	система управления знаниями в области старения
Регистрация:	по выбору
Язык(и):	Английский
Автор:	Александр Жаворонков, Чарльз Кантор, Константин Романцов, Эли Мохамад, Зелька Смит-Макбридж, Ольга Коборова, Антон Колесов, Варвара Конова, Кирилл Алявдин, Павел Поляков, Крис Смелик, Дэвид Эспри, Дмитрий Иванов, Григорий Вайгандт, Рассел Хан, Джейн Ян, Василиса Руднева, Валерия Колесникова
Начало работы:	24 февраля, 2011
Текущий статус:	Функционирует

International Aging Research Portfolio (IARP) - некоммерческая, свободно доступная система управления знаниями на английском языке, объединяющая информацию о грантах, публикациях, конференциях в естественных, общественных и поведенческих науках^[1]. Система разрабатывалась под руководством российских учёных^[2][3].

Кроме расширенного поиска и инструментов для визуального анализа трендов, система содержит каталог исследовательских проектов, распределённых по категориям, относящимся к геронтологии. Для распределения исследовательских проектов в соответствующие категории система использует автоматические алгоритмы классификации с элементами машинного обучения. Каталог проверяется редакторами-экспертами в своих категориях и членами научного консультативного совета. Главой научного консультативного совета является Чарльз Кантор.

Обзор

Наука о старении является междисциплинарной областью, охватывающей многие области естественных, социальных и поведенческих наук, и исследовательские данные в значительной степени рассредоточены. Популярные ресурсы, вроде PubMed и Google Scholar, предоставляют доступ как к старым, так и к наиболее актуальным научным аннотациям и полнотекстовым публикациям. Однако ресурсов, объединяющих международные базы данных научных публикаций, аннотации к грантам и базы данных клинических исследований, очень мало.

Аннотации к грантам обычно публикуются финансирующими организациями и предшествуют публикациям в рецензируемой литературе. Некоторые из экспериментов, описанных в аннотациях к грантам, стают неудачными или не приводят к рецензируемым публикациям. Для избежания дублирования, а также развития научного сотрудничества, важно иметь доступ ко всей доступной в мире грантовой информации, чтобы отслеживать финансирование подобных проектов.

Базы данных IARP объединяют информацию об исследовательских грантах, рецензированных публикациях и выданных патентных заявках из многих источников. Базы данных используют гибкие механизмы классификации проектов и инструменты для анализа взаимосвязей проектов и трендов. Система позволяет учёным осуществлять поиск по централизованной базе проектов, классифицировать и категоризировать геронтологические проекты, а также анализировать аспекты финансирования по нескольким дисциплинам исследования. IARP разработана для улучшения размещения и приоритезации ограниченного финансирования исследований, уменьшения совпадения проектов и повышения уровня научного сотрудничества, таким образом, ускоряя прогресс науки и медицины в быстро растущей области знаний.

Система IARP собирает данные по грантам из многих источников, включая Национальные институты здравоохранения США, Европейскую комиссию, Канадские институты исследований в области здравоохранения, Национальный научный фонд США, Национальный совет по исследованиям в области здравоохранения Австралии и аннотации публикаций по лицензии базы данных MEDLINE. Результаты поиска по базе данных могут быть представлены в виде графиков и диаграмм для анализа трендов. Одной из основных особенностей системы IARP является возможность автоматической и ручной классификации научно-исследовательских проектов в структурированный каталог. Редакторы научно-консультативного совета IARP и научные редакторы-добровольцы классифицируют проекты из базы данных в соответствующие категории. Эти классифицированные вручную проекты стают обучающими выборками для автоматических алгоритмов классификации с элементами машинного обучения. Поскольку система IARP является модульной и портативной, она может быть использована в качестве платформы для разработки других систем управления знаниями в исследованиях процесса старения.

Содержание

IARP содержит данные по грантам Национальных институтов здравоохранения США, Европейской комиссии, Канадских институтов исследований в области здравоохранения, Национального научного фонда США, Национального совета по исследованиям в области здравоохранения Австралии и многих других источников, а также аннотации к статьям MEDLINE по лицензии Национальной медицинской библиотеки США. Команда добровольцев по развитию IARP работает непосредственно с издательствами и регулярно обновляет базу данных либо автоматически, либо путём ввода данных, полученных на физическом носителе.

Характеристики

Простой поиск

Простой поиск в IARP может быть произведён путём ввода ключевых аспектов предмета в окно поиска. IARP переводит этот первоначальный запрос и автоматически добавляет поля имён, булевы операции, а также улучшает поисковое предписание, в частности, сочетая (используя оператор "ИЛИ") слова текста.

'Programmed Theory Aging'

переводится как

("Programmed" ИЛИ "Theory" ИЛИ "Aging")

Расширенный поиск

Расширенный поиск позволяет пользователям ограничивать критерии поиска проектов по дате создания, области исследования и механизму финансирования. Кроме описания, каждый исследовательский проект содержит информацию о финансирующей организации, принимающей организации и ведущем исследователе. Расширенный поиск также связывает текущий проект со схожими проектами и механизмами финансирования.

Для эффективного использования функций расширенного поиска, пользователь должен обладать определённым уровнем знаний в области исследования и использовать соответствующие и точные ключевые слова и ограничения. Форма позволяет пользователям указывать несколько значений для точного поиска данных.

[Ключевые слова]. Пользователи могут использовать булевы операции и маску для поиска информации в описании проекта и названии полей.

Примеры поисковых запросов:

'nerv*'

'stem AND cell NOT embryonic'

'accumulation amyloid alzheimers'

[Области исследования]. Пользователи могут ограничить поиск, выбрав желаемые направления исследований из дерева категорий.

[Теории старения]. Пользователи могут выбрать несколько значений из списка теорий старения. Кроме того, пользователи могут ограничить свой поиск по: финансовому году, номеру проекта, датам начала и окончания проекта, получателю и финансирующим организациям, типу финансирования.

Тренды и инструменты

Вебсайт располагает набором инструментов для визуализации данных проекта в виде диаграмм, графиков и сравнительных таблиц. Интерфейс позволяет пользователям создавать двумерные диаграммы сравнения финансирования научных исследований по году, организации, университету, ведущему исследователю, региону и категории.

Сводная статистика

Сводная статистика предоставляет комплексный анализ данных, хранящихся в системе. Она отображает текущее состояние базы данных проектов и публикаций в деталях: общее количество, количество категоризированных/категоризированных вручную, относящихся к геронтологии, некатегоризированных. Отображаются топ 50 активных проектов, завершённых проектов по общей сумме финансирования, ведущих стран, штатов США, исследователей, финансирующих и принимающих организаций, также по сумме финансирования.

Другие инструменты

Система также включает в себя такие инструменты, как "Поиск грантодателей", "Кто есть кто", "Финансирующие организации", "События биотехнологии" и "Интернет-конференции", которые находятся в различных стадиях разработки. Цель этих инструментов заключается в обеспечении научно-исследовательского сообщества возможностью определять организации, финансирующие схожие исследовательские проекты, выявление возможных сотрудников и поиск конференций, относящихся к их научным интересам.

Классификация данных

Автоматическая классификация проектов

Автоматическая классификация используется для определения проектов, относящихся к исследованиям старости, в рамках больших наборов данных и для определения проектов в соответствующие семантические группы. Система использует два алгоритма классификации с элементами машинного обучения: Метод опорных векторов (SVM) и циклический нейронно-сетевой анализ логических множителей (BFA)^[4].

Ручная классификация проектов

Поскольку текущие автоматические алгоритмы классификации ограничены и требуют от каждой категории наличия относительно большой обучающей выборки, система в значительной мере опирается на ручную классификацию редакторами-экспертами в своих категориях. Административный интерфейс редакторов категорий даёт возможность членам научно-консультативного совета, директорам институтов и начальникам лабораторий курировать категории верхнего уровня и делегировать управление нижестоящих категорий старшим студентам.

Поиск похожих грантов и публикаций

IARP имеет возможность автоматического выявления схожих и аналогичных проектов в базе данных с использованием алгоритма анализа аннотаций проектов, патентов и публикаций. Такой тип расширенного анализа проектов помогает избегать перекрытия проектов и дублирования финансирования аналогичных программ и в то же время выявляет пробелы в исследованиях для потенциального финансирования.

Другие ресурсы, использующие базу данных IARP

Проект FundingTrends осуществляет простой поиск по ключевым словам среди миллионов биомедицинских проектов, поддерживаемых основными финансирующими организациями мира. Он также показывает ежегодные суммы финансирования проектов, содержащих ключевые слова.

Проект Aging.CC также использует базу данных IARP для простого поиска биомедицинских проектов.

Примечания

1. ↑ Начала работу первая в мире глобальная система по управлению знаниями в области старения. Вестник геронтологического общества Российской Академии наук (29 сентября 2011). Архивировано из первоисточника 30 августа 2012.
2. ↑ Вышла статья с подробным описанием International Aging Research Portfolio. "Вечный Разум" (29 сентября 2011). Архивировано из первоисточника 30 августа 2012.
3. ↑ International Aging Research Portfolio (IARP). Компания IT-SKY (29 сентября 2011). Архивировано из первоисточника 30 августа 2012.
4. ↑  (англ.)Alex Zhavoronkov, Charles R. Cantor Methods for Structuring Scientific Knowledge from Many Areas Related to Aging Research. PLoS ONE (29 сентября 2011). Архивировано из первоисточника 30 августа 2012.

Ссылки

• Официальный сайт IARP
• англ. Пресс-релиз CORDIS
• англ. Обучающие видео IARP
• англ. Профессиональный форум IARP

Связать^?

На эту статью не ссылаются другие статьи Википедии. Пожалуйста, воспользуйтесь подсказкой и установите ссылки в соответствии с принятыми рекомендациями.